RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 IGFBP5P24593 272 aa24.77■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 PURAQ00577 322 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 LDLRAD1Q5T700 205 aa24.77■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 SBSNQ6UWP8 590 aa24.77■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 TAS2R42Q7RTR8 314 aa24.77■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 AADATQ8N5Z0 425 aa24.77■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 HTRA1Q92743 480 aa24.77■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 MARCH2Q9P0N8 246 aa24.77■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa24.77■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 SCELO95171 688 aa24.77■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 AKT1P31749 480 aa24.77■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 DAPP51397 102 aa24.77■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 CLCN7P51798 805 aa24.77■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 PHKG1Q16816 387 aa24.77■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 SCAIQ8N9R8 606 aa24.77■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 ATAD1Q8NBU5 361 aa24.77■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 SUSD3Q96L08 255 aa24.77■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 DPY30Q9C005 99 aa24.77■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 TMEM45AQ9NWC5 275 aa24.77■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 TAPBPO15533 448 aa24.76■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 LCKP06239 509 aa24.76■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 MSH3P20585 1137 aa24.76■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 CA5AP35218 305 aa24.76■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 KCNQ1P51787 676 aa24.76■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 ACOX1Q15067 660 aa24.76■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 STARD8Q92502 1023 aa24.76■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 OR52E6Q96RD3 313 aa24.76■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 MGME1Q9BQP7 344 aa24.76■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 INPP5KQ9BT40 448 aa24.76■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa24.76■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 DUSP21Q9H596 190 aa24.76■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 SPC25Q9HBM1 224 aa24.76■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 BMP1P13497 986 aa24.76■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 CD40LGP29965 261 aa24.76■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 CPT1AP50416 773 aa24.76■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 SLC14A1Q13336 389 aa24.76■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 TUSC3Q13454 348 aa24.76■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 GTF2H3Q13889 308 aa24.76■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 CPZQ66K79 652 aa24.76■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 SLC22A15Q8IZD6 547 aa24.76■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 ZNF566Q969W8 418 aa24.76■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 NECTIN3Q9NQS3 549 aa24.76■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 ABCB10Q9NRK6 738 aa24.76■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 TLR5O60602 858 aa24.75■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 NRIP1P48552 1158 aa24.75■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 SAPCD2Q86UD0 394 aa24.75■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 ZBTB18Q99592 522 aa24.75■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 RASSF1Q9NS23 344 aa24.75■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 NUDT4Q9NZJ9 180 aa24.75■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 ANKMY1Q9P2S6 941 aa24.75■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 ZNF229Q9UJW7 825 aa24.75■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 C2orf81A6NN90 581 aa24.75■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 M0QX08 132 aa24.75■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 SEC24AO95486 1093 aa24.75■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 ALOX5P09917 674 aa24.75■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 MAGP20916 626 aa24.75■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 GZMMP51124 257 aa24.75■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.554e-8■□□□□ 9.2
SENP3-201ENST00000321337 PADI3Q9ULW8 664 aa24.75■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 DNAJB5O75953 348 aa24.74■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 LRRC8DQ7L1W4 858 aa24.74■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 TMED5Q9Y3A6 229 aa24.74■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa24.74■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 FFAR2O15552 330 aa24.74■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 PRAMEF12O95522 483 aa24.74■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 LPOP22079 712 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 SLC6A4P31645 630 aa24.74■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 CDKN2CP42773 168 aa24.74■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 ZNF540Q8NDQ6 660 aa24.74■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 KCNJ9Q92806 393 aa24.74■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 LGALS12Q96DT0 336 aa24.74■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 AP5M1Q9H0R1 490 aa24.74■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 DSN1Q9H410 356 aa24.74■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 CCSER2Q9H7U1 834 aa24.74■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 ORC6Q9Y5N6 252 aa24.74■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 MYO1GB0I1T2 1018 aa24.73■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 SEC22BO75396 215 aa24.73■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 SEPHS1P49903 392 aa24.73■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 ZNF280BQ86YH2 543 aa24.73■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa24.73■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa24.73■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 PYURFQ96I23 114 aa24.73■■□□□ 1.55
SENP3-201ENST00000321337 PPP3R2Q96LZ3 170 aa24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms