RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM46DQ8NEK8 389 aa26.72■■□□□ 1.87
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CXorf40BQ96DE9 158 aa26.72■■□□□ 1.87
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CTDNEP1-201ENST00000318988 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa26.67■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 KRT87PA6NCN2 255 aa26.66■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF839A8K0R7 811 aa26.66■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 YY2O15391 372 aa26.66■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 NPHS1O60500 1241 aa26.66■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 STK16O75716 305 aa26.66■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC16A8O95907 504 aa26.66■■□□□ 1.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 SERPINB5P36952 375 aa26.66■■□□□ 1.86
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