RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317868.8

ATG4C-201, Transcript of autophagy related 4C cysteine peptidase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG4C, Length 2,938 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4C-201ENST00000317868 STK16O75716 305 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 C1SP09871 688 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 PFKLP17858 780 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 IL1RNP18510 177 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 PTPN6P29350 595 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 ALDH3A2P51648 485 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 ARSFP54793 590 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 PHC1P78364 1004 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 SPANXN4Q5MJ08 99 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 C22orf39Q6P5X5 142 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 HIC2Q96JB3 615 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 FCRL1Q96LA6 429 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 SLC12A9Q9BXP2 914 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 OCEL1Q9H607 264 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP13.48□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 C1orf109Q9NX04 203 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 AP3M1Q9Y2T2 418 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 CLIC3O95833 236 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 MT-ND1P03886 318 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 MPC1LP0DKB6 136 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 TCF3P15923 654 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 HLA-FP30511 346 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 AKT1P31749 480 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 HS6ST3Q8IZP7 471 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF786Q8N393 782 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 FAM86B1Q8N7N1 296 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 OR2T12Q8NG77 320 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 ITFG1Q8TB96 612 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 RDH12Q96NR8 316 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 SUV39H2Q9H5I1 410 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 PIF1Q9H611 641 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 FAM220BPB1ANY3 271 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 CLDN9O95484 217 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 ANXA5P08758 320 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 BCKDHAP12694 445 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 STK19P49842 368 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 C1orf53Q5VUE5 145 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 NECAB2Q7Z6G3 386 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 TCAIMQ8N3R3 496 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 L3MBTL4Q8NA19 623 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 PJA1Q8NG27 643 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 TMBIM1Q969X1 311 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 ULK4Q96C45 1275 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 VPS50Q96JG6 964 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 ZBTB18Q99592 522 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 DPY30Q9C005 99 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 CEP44Q9C0F1 390 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 ZBP1Q9H171 429 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 SLC6A13Q9NSD5 602 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 DENND4AQ7Z401 1863 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 CARNS1A5YM72 827 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 CCDC160A6NGH7 325 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 RETP07949 1114 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 CDK4P11802 303 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 CLDN8P56748 225 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 DAG1Q14118 895 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 MAPKAPK3Q16644 382 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 CACHD1Q5VU97 1274 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 ATG9BQ674R7 924 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 USP45Q70EL2 814 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 LPCAT2Q7L5N7 544 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 GPR149Q86SP6 731 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 CYGBQ8WWM9 190 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 FAM83CQ9BQN1 747 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 USE1Q9NZ43 259 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 GFYI3L273 518 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 LEFTY2O00292 366 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 TGM5O43548 720 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 FKTNO75072 461 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 CPNE6O95741 557 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 PDYNP01213 254 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 C8GP07360 202 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 PCSK2P16519 638 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 SOX11P35716 441 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 RPIAP49247 311 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 SP140Q13342 867 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 LILRA6Q6PI73 481 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 RFLNAQ6ZTI6 216 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 ASB11Q8WXH4 323 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 TESCQ96BS2 214 aa13.46□□□□□ -0.25
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms