RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 PYDC1Q8WXC3 89 aa22.2■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 SLC39A3Q9BRY0 314 aa22.2■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 SLC52A3Q9NQ40 469 aa22.2■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 MAP10Q9P2G4 905 aa22.2■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 DENND4AQ7Z401 1863 aa22.2■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 ULK1O75385 1050 aa22.19■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 TNFRSF4P43489 277 aa22.19■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 PFN3P60673 137 aa22.19■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 HTR4Q13639 388 aa22.19■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 WLSQ5T9L3 541 aa22.19■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA1211LQ6NV74 962 aa22.19■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 FAM156AQ8NDB6 213 aa22.19■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa22.19■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 LRCH3Q96II8 777 aa22.19■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 STOML1Q9UBI4 398 aa22.19■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1W2PP55 124 aa22.19■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 BBIP1A8MTZ0 92 aa22.19■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 MANBAO00462 879 aa22.19■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 PCDH8O95206 1070 aa22.19■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 HMGCS1Q01581 520 aa22.19■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 GRIK2Q13002 908 aa22.19■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 CRTC3Q6UUV7 619 aa22.19■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 NRG4Q8WWG1 115 aa22.19■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 FBXL8Q96CD0 374 aa22.19■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 CROTQ9UKG9 612 aa22.19■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa22.19■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 H3BM21 787 aa22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 SLC22A3O75751 556 aa22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 PCCBP05166 539 aa22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 ME2P23368 584 aa22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 MS4A2Q01362 244 aa22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 EMX2Q04743 252 aa22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 AAK1Q2M2I8 961 aa22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 XKR5Q6UX68 686 aa22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 USP7Q93009 1102 aa22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 IL1RL2Q9HB29 575 aa22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 S100A14Q9HCY8 104 aa22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 DNAJC11Q9NVH1 559 aa22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 NDUFAF1Q9Y375 327 aa22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 ANGPT2O15123 496 aa22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 PRAMEF4O60810 478 aa22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 FKBP6O75344 327 aa22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 G6PDP11413 515 aa22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 ANPEPP15144 967 aa22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 C5AR1P21730 350 aa22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 AP2B1P63010 937 aa22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 GTF2H3Q13889 308 aa22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 HACD2Q6Y1H2 254 aa22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 JADE3Q92613 823 aa22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 VPS33AQ96AX1 596 aa22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 HIC2Q96JB3 615 aa22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 HEBP1Q9NRV9 189 aa22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 EPS15L1Q9UBC2 864 aa22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 PRKAB1Q9Y478 270 aa22.18■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 RGS14O43566 566 aa22.17■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 ADH1BP00325 375 aa22.17■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 CATP04040 527 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 IL12AP29459 219 aa22.17■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 BMP8BP34820 402 aa22.17■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 RCAN2Q14206 197 aa22.17■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 IL23RQ5VWK5 629 aa22.17■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 PNCKQ6P2M8 343 aa22.17■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM46Q7Z4K8 759 aa22.17■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 PROKR1Q8TCW9 393 aa22.17■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 SPDL1Q96EA4 605 aa22.17■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 SLC29A3Q9BZD2 475 aa22.17■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 SPAG4Q9NPE6 437 aa22.17■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 C15orf41Q9Y2V0 281 aa22.17■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa22.17■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 ANHXE9PGG2 379 aa22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 SLC28A1O00337 649 aa22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 NPC1O15118 1278 aa22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 POP7O75817 140 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 SLC2A4P14672 509 aa22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 KCNK10P57789 538 aa22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 RPS14P62263 151 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 RPL38P63173 70 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 WSCD2Q2TBF2 565 aa22.16■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 AAGABQ6PD74 315 aa22.16■■□□□ 1.14
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