RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 BTN3A1O00481 513 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 PRRG2O14669 202 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 GSTM1P09488 218 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 ABOP16442 354 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 IL1R2P27930 398 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 NSG1P42857 185 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 CTSCP53634 463 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 CSNK1G2P78368 415 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 GSTM4Q03013 218 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 UBXN1Q04323 297 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 Q0VFX4 171 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 GRM7Q14831 915 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 BCL7AQ4VC05 210 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 ODF2Q5BJF6 829 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 TCTE1Q5JU00 501 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 ABHD17BQ5VST6 288 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 CNSTQ6PJW8 725 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM151BQ6UXP7 276 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 TTLL10Q6ZVT0 673 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 DAAM2Q86T65 1068 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 CATSPER1Q8NEC5 780 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 OR52E1Q8NGJ3 308 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 NINJ1Q92982 152 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC22A18Q96BI1 424 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 ULK4Q96C45 1275 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 EID2BQ96D98 161 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 PPM1MQ96MI6 270 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF559Q9BR84 538 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 CRB3Q9BUF7 120 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF32Q9H0A6 362 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 ENKD1Q9H0I2 346 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC26A1Q9H2B4 701 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 RIC8BQ9NVN3 520 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 SMOXQ9NWM0 555 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 OR6C2Q9NZP2 312 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 POLG2Q9UHN1 485 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 LCMT1Q9UIC8 334 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 SEC16AO15027 2179 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 NAV3Q8IVL0 2385 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 NUP210LQ5VU65 1888 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 HIVEP1P15822 2718 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC78A2IDD5 438 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 F8W8V4 182 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNK1O00180 336 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 BTN3A3O00478 584 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 SOCS6O14544 535 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 DSCR3O14972 297 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 STX7O15400 261 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 TTI1O43156 1089 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 PRAMEF2O60811 474 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 BMP10O95393 424 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 PRAMEF1O95521 474 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 TSPAN12O95859 305 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 MMP2P08253 660 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 KLK7P49862 253 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE2HP62256 183 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 CACNG1Q06432 222 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 RPA4Q13156 261 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 PCOLCEQ15113 449 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 PDK1Q15118 436 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT31Q15323 416 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 NKG7Q16617 165 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 KIRREL2Q6UWL6 708 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 NDUFAF7Q7L592 441 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 DET1Q7L5Y6 550 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 NLRP9Q7RTR0 991 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 SPPL2CQ8IUH8 684 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 NIPA2Q8N8Q9 360 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 OR11G2Q8NGC1 345 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF398Q8TD17 642 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 ASB5Q8WWX0 329 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 MIEF2Q96C03 454 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC45Q96CN5 670 aa7.56□□□□□ -1.2
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