RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277657.12

CCDC7-201, Transcript of coiled-coil domain containing 7, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC7, Length 1,899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7-201ENST00000277657 DOCK9Q9BZ29 2069 aa21.52■■□□□ 1.04
CCDC7-201ENST00000277657 AIM2O14862 343 aa21.52■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 PEX11AO75192 247 aa21.52■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 WDR47O94967 919 aa21.52■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 NUDT2P50583 147 aa21.52■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 INPP5AQ14642 412 aa21.52■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 NEK5Q6P3R8 708 aa21.52■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 CRTC3Q6UUV7 619 aa21.52■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 IL27RAQ6UWB1 636 aa21.52■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa21.52■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 FOXJ1Q92949 421 aa21.52■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 SLC29A3Q9BZD2 475 aa21.52■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 DPEP2Q9H4A9 486 aa21.52■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 FZD4Q9ULV1 537 aa21.52■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 CLDN9O95484 217 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 ASGR2P07307 311 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 IDO1P14902 403 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 PFN3P60673 137 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 ABRAXAS2Q15018 415 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 SNCBQ16143 134 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 MAP7D1Q3KQU3 841 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 DEFB107AQ8IZN7 70 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 ATL1Q8WXF7 558 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 CLPTM1LQ96KA5 538 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 EFCAB1Q9HAE3 211 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 DNAJC11Q9NVH1 559 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 CCDC167Q9P0B6 97 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 GPR45Q9Y5Y3 372 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 A0A1W2PQU0 124 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 C1orf105O95561 183 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 ERVK-8P63133 956 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 CCSMST1Q4G0I0 132 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 GGTA1PQ4G0N0 100 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 FBXO43Q4G163 708 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 C6orf136Q5SQH8 315 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 PGM2L1Q6PCE3 622 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 PAOXQ6QHF9 649 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 USP30Q70CQ3 517 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 FUNDC1Q8IVP5 155 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 DSELQ8IZU8 1212 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 MIER2Q8N344 545 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 OR9I1Q8NGQ6 314 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 PYCR2Q96C36 320 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 SIPA1Q96FS4 1042 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 MSANTD3Q96H12 275 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 WDR26Q9H7D7 661 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 PREBQ9HCU5 417 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 MYO10Q9HD67 2058 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 AIG1Q9NVV5 245 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 SLC7A8Q9UHI5 535 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 SLC22A14Q9Y267 594 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 CCL27Q9Y4X3 112 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 GPR89AB7ZAQ6 455 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 NARSO43776 548 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 GPR89BP0CG08 455 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 BDKRB1P46663 353 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 GRIK2Q13002 908 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 STX5Q13190 355 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 SGCGQ13326 291 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 CCINQ13939 588 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 NFE2L1Q14494 772 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 KIF19Q2TAC6 998 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 DOK6Q6PKX4 331 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 SFRP1Q8N474 314 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 OXR1Q8N573 874 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 SNX31Q8N9S9 440 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 PKP4Q99569 1192 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 SLC17A9Q9BYT1 436 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 OSBPL6Q9BZF3 934 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 ATG10Q9H0Y0 220 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 ACTR8Q9H981 624 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 LSM1O15116 133 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 ACADLP28330 430 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 DIO3P55073 304 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 RPA4Q13156 261 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 AGTRAPQ6RW13 159 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 C16orf89Q6UX73 402 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 TRIM46Q7Z4K8 759 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 KBTBD6Q86V97 674 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 LRRTM4Q86VH4 590 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 HORMAD1Q86X24 394 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 L3MBTL4Q8NA19 623 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 KLK6Q92876 244 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 USP7Q93009 1102 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 MRGPRX1Q96LB2 322 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 SLC25A23Q9BV35 468 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 BRINP2Q9C0B6 783 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 NDE1Q9NXR1 346 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 OR1A2Q9Y585 309 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 NUMA1Q14980 2115 aa21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms