RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 MYO1AQ9UBC5 1043 aa15.79■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 ZANQ9Y493 2812 aa15.78■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 DNAJC13O75165 2243 aa15.78■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 SMTNL1A8MU46 457 aa15.78■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 PIRTP0C851 137 aa15.78■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 MYBL1P10243 752 aa15.78■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 TMPRSS15P98073 1019 aa15.78■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 PMP22Q01453 160 aa15.78■□□□□ 0.12
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SPCS1-201ENST00000233025 BRSK1Q8TDC3 778 aa15.78■□□□□ 0.12
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SPCS1-201ENST00000233025 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP15.78■□□□□ 0.12
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SPCS1-201ENST00000233025 PMPCBO75439 489 aa15.77■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 RARAP10276 462 aa15.77■□□□□ 0.12
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SPCS1-201ENST00000233025 FILIP1LQ4L180 1135 aa15.77■□□□□ 0.12
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SPCS1-201ENST00000233025 SPPL2CQ8IUH8 684 aa15.77■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC49Q8IUZ0 686 aa15.77■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 NIPA2Q8N8Q9 360 aa15.77■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 ACVR1CQ8NER5 493 aa15.77■□□□□ 0.12
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SPCS1-201ENST00000233025 HSPH1Q92598 858 aa15.77■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 TRIB3Q96RU7 358 aa15.77■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 SLC26A1Q9H2B4 701 aa15.77■□□□□ 0.12
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SPCS1-201ENST00000233025 DEF6Q9H4E7 631 aa15.77■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 PCDH18Q9HCL0 1135 aa15.77■□□□□ 0.12
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SPCS1-201ENST00000233025 TMEM220Q6QAJ8 160 aa15.76■□□□□ 0.11
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SPCS1-201ENST00000233025 LCN9Q8WX39 176 aa15.76■□□□□ 0.11
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SPCS1-201ENST00000233025 BTBD6Q96KE9 485 aa15.76■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 TTC25Q96NG3 672 aa15.76■□□□□ 0.11
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SPCS1-201ENST00000233025 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP15.76■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 THAP2Q9H0W7 228 aa15.76■□□□□ 0.11
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SPCS1-201ENST00000233025 PTGFRNQ9P2B2 879 aa15.76■□□□□ 0.11
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SPCS1-201ENST00000233025 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 HIVEP2P31629 2446 aa15.76■□□□□ 0.11
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SPCS1-201ENST00000233025 MATN3O15232 486 aa15.75■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 MFSD11O43934 449 aa15.75■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 CD86P42081 329 aa15.75■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 TFF3Q07654 80 aa15.75■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 GALNT2Q10471 571 aa15.75■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 BOLA3Q53S33 107 aa15.75■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa15.75■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 FATE1Q969F0 183 aa15.75■□□□□ 0.11
SPCS1-201ENST00000233025 GPR137Q96N19 417 aa15.75■□□□□ 0.11
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