RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 STON1Q9Y6Q2 735 aa23.38■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 ANTXRLA6NF34 631 aa23.37■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC154A6NI56 674 aa23.37■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 MANBAO00462 879 aa23.37■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 MS4A2Q01362 244 aa23.37■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 DHDDSQ86SQ9 333 aa23.37■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM156AQ8NDB6 213 aa23.37■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 TEX37Q96LM6 180 aa23.37■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 RIPOR3Q96MK2 946 aa23.37■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC39A3Q9BRY0 314 aa23.37■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 MAP10Q9P2G4 905 aa23.37■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa23.37■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 HCN2Q9UL51 889 aa23.37■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 REV3LO60673 3130 aa23.37■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC5A10A0PJK1 596 aa23.37■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC2A4P14672 509 aa23.37■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 WASP42768 502 aa23.37■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC7A2P52569 658 aa23.37■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 IL23RQ5VWK5 629 aa23.37■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 NLRP8Q86W28 1048 aa23.37■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 FBXL8Q96CD0 374 aa23.37■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC45A3Q96JT2 553 aa23.37■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 ATG10Q9H0Y0 220 aa23.37■■□□□ 1.33
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RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM181Q9P2C4 612 aa23.37■■□□□ 1.33
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RPUSD1-201ENST00000007264 SLC22A14Q9Y267 594 aa23.37■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM234BA2RU67 622 aa23.36■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 EPORP19235 508 aa23.36■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 ITPKAP23677 461 aa23.36■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 RPL38P63173 70 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 PRKG2Q13237 762 aa23.36■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 ADAM15Q13444 863 aa23.36■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 BCL7AQ4VC05 210 aa23.36■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 TRIM46Q7Z4K8 759 aa23.36■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 CACUL1Q86Y37 369 aa23.36■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 ATL1Q8WXF7 558 aa23.36■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 FADS3Q9Y5Q0 445 aa23.36■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 ARHGEF33A8MVX0 844 aa23.36■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 H3BM21 787 aa23.36■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 G6PDP11413 515 aa23.36■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
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RPUSD1-201ENST00000007264 SLC22A15Q8IZD6 547 aa23.36■■□□□ 1.33
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RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 VPS33AQ96AX1 596 aa23.36■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 GDF15Q99988 308 aa23.36■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 ELOVL6Q9H5J4 265 aa23.36■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 TRIM39Q9HCM9 518 aa23.36■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 CLEC1BQ9P126 229 aa23.36■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 SNX6Q9UNH7 406 aa23.36■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 CCL27Q9Y4X3 112 aa23.36■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 KRT87PA6NCN2 255 aa23.35■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 STAMBPO95630 424 aa23.35■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 GNPDA1P46926 289 aa23.35■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 NFYCQ13952 458 aa23.35■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 SMU1Q2TAY7 513 aa23.35■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 GGTA1PQ4G0N0 100 aa23.35■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 ZFP1Q6P2D0 407 aa23.35■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 RASGRP3Q8IV61 690 aa23.35■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 MINDY1Q8N5J2 469 aa23.35■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 PROKR1Q8TCW9 393 aa23.35■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 USP7Q93009 1102 aa23.35■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC138Q96M89 665 aa23.35■■□□□ 1.33
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RPUSD1-201ENST00000007264 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
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RPUSD1-201ENST00000007264 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
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RPUSD1-201ENST00000007264 TIGD2Q4W5G0 525 aa23.34■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa23.34■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 NEK5Q6P3R8 708 aa23.34■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 SPATA24Q86W54 205 aa23.34■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 CFAP206Q8IYR0 622 aa23.34■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 LRRC58Q96CX6 371 aa23.34■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 S1PR5Q9H228 398 aa23.34■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC52A3Q9NQ40 469 aa23.34■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 DYTNA2CJ06 578 aa23.34■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 ACOT8O14734 319 aa23.34■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 SEC22BO75396 215 aa23.34■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 EEDO75530 441 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 CASP2P42575 452 aa23.34■■□□□ 1.33
RPUSD1-201ENST00000007264 FOXM1Q08050 763 aa23.34■■□□□ 1.33
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