RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000101395.2

Hoxa4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa4, Length 1,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ssxb6A2BI74 170 aa28.13■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 P01664 111 aa28.13■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fut10Q5F2L2 481 aa28.13■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dll1Q61483 722 aa28.13■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fgfr3Q61851 801 aa28.13■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 VclQ64727 1066 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Stk38lQ7TSE6 464 aa28.13■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mapkap1Q8BKH7 522 aa28.13■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Arhgef3Q91X46 524 aa28.13■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mrpl37Q921S7 423 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm1110F6Y113 635 aa28.12■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm42641I6L9G2 585 aa28.12■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm6356L7N2A7 188 aa28.12■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Matn2O08746 956 aa28.12■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 LcatP16301 438 aa28.12■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fgf14P70379 247 aa28.12■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 D17Wsu92eQ3TT38 291 aa28.12■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dtx3lQ3UIR3 748 aa28.12■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gpr149Q3UVY1 732 aa28.12■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Il1rapQ61730 570 aa28.12■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kctd12Q6WVG3 327 aa28.12■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 C2cd2lQ80X80 706 aa28.12■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tlk1Q8C0V0 766 aa28.12■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Capn8Q91VA3 703 aa28.12■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mrpl1Q99N96 336 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Uba7Q9DBK7 977 aa28.12■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rbck1Q9WUB0 508 aa28.12■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 H2-BlV9GXR0 257 aa28.12■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 R3hdmlA2A5I3 253 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pot1bH7BX60 640 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 E2f3O35261 457 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Epb42P49222 691 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gpr165Q3V3A3 455 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 AbrQ5SSL4 859 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sel1l3Q80TS8 1137 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc17a6Q8BLE7 582 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cep68Q8C0D9 733 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tfb1mQ8JZM0 345 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nfatc4Q8K120 901 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr868Q8VFI8 309 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cryl1Q99KP3 319 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ms4a10Q99N03 267 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tnfsf14Q9QYH9 239 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm20403G3UYB0 123 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pik3r2O08908 722 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tbx4P70325 552 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 XpaQ64267 272 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr1197Q7TR13 314 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr1196Q7TR14 314 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ap4e1Q80V94 1122 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tmtc4Q8BG19 741 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kansl2Q8BQR4 486 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lats1Q8BYR2 1129 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Galnt13Q8CF93 556 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 C1rbQ8CFG9 706 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Apbb3Q8R1C9 486 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr1Q8VGI1 314 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rab28Q99KL7 221 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Bpifa3Q9D9J8 232 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Poc5Q9DBS8 558 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 NvlQ9DBY8 855 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 PrepQ9QUR6 710 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rgs20Q9QZB1 239 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 MycsQ9Z304 431 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Plce1Q8K4S1 2282 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Plxnd1Q3UH93 1925 aa28.1■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1700011I03RikE9PYL8 271 aa28.1■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zfp277E9Q6D6 583 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr891E9Q843 316 aa28.1■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 E2f6O54917 272 aa28.1■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pou4f1P17208 421 aa28.1■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Il1rnP25085 178 aa28.1■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 LmnaP48678 665 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cd36Q08857 472 aa28.1■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ak8Q32M07 479 aa28.1■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sema3gQ4LFA9 780 aa28.1■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Smg5Q6ZPY2 1017 aa28.1■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Acap2Q6ZQK5 770 aa28.1■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Med26Q7TN02 588 aa28.1■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sgo2Q7TSY8 1164 aa28.1■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fbxo2Q80UW2 297 aa28.1■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Znf569Q80W31 679 aa28.1■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ap5m1Q8BJ63 490 aa28.1■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tmem74Q8BQU7 305 aa28.1■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 3300002I08RikQ9CXH3 147 aa28.1■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slco6d1Q9D5W6 683 aa28.1■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rsc1a1Q9ER99 582 aa28.1■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ropn1Q9ESG2 212 aa28.1■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pin1Q9QUR7 165 aa28.1■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cdh13Q9WTR5 714 aa28.1■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cib2Q9Z309 187 aa28.1■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Adh6aE9Q5Z6 375 aa28.09■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zfp607bG3X9H3 648 aa28.09■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Surf2P09926 257 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tgfb3P17125 410 aa28.09■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Traf6P70196 530 aa28.09■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Larp4bQ6A0A2 741 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Smpd4Q6ZPR5 823 aa28.09■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rps27lQ6ZWY3 84 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fbxo22Q78JE5 402 aa28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.8 ms