RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000054930.6

Ptx4-201, Transcript of Pentraxin-4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptx4, Length 1,582 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm5936A2BG95 728 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Zmynd12A2BGJ5 363 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm5640A3KG49 728 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm14862B1AV28 81 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 NuggcD3YWJ0 796 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Arl9F7BE40 171 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Alkal1J3QPP8 127 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Capn5O08688 640 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cbx4O55187 551 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Stam2O88811 523 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Krt4P07744 525 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Il1rnP25085 178 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 FaslgP41047 279 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Traf6P70196 530 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tbx1P70323 479 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rpl10lP86048 214 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Thumpd3P97770 505 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ripply1Q2WG77 201 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rsrp1Q3UC65 298 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm5460Q3UQ97 254 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Bahd1Q497V6 772 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Spa17Q62252 149 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ca4Q64444 305 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rpl10Q6ZWV3 214 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Olfr1197Q7TR13 314 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Olfr1196Q7TR14 314 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Kirrel1Q80W68 789 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 CyrenQ8BHZ5 157 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tyw1Q8BJM7 721 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Clasp2Q8BRT1 1286 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 LnpepQ8C129 1025 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Zcchc9Q8R1J3 271 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fitm1Q91V79 292 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rpe65Q91ZQ5 533 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Wdr45bQ9CR39 344 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ndufaf1Q9CWX2 328 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cldn22Q9D7U6 220 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Uba7Q9DBK7 977 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Psmd13Q9WVJ2 376 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gipc2Q9Z2H7 314 aa13.4□□□□□ -0.26
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cacna1cQ01815 2139 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ccdc194A0A140LIT1 234 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Pcna-ps2A0A140T8V5 261 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Pgbd5D3YZI9 523 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 SelenonD3Z2R5 557 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Zfp599E9PWP1 548 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm20390E9PZF0 267 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm2237E9Q501 211 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rap1gds1E9Q912 607 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Serpinb6eI7HJI3 429 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm3591K7N6X2 186 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Sec22bO08547 215 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 KitP05532 979 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ctps2P70303 586 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Stx2Q00262 289 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Nme2Q01768 152 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 GiprQ0P543 460 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 HdxQ14B70 692 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Pon2Q62086 354 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Scaf4Q6PFF0 1209 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rps27lQ6ZWY3 84 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Coq4Q8BGB8 266 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Stbd1Q8C7E7 338 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Usp27Q8CEG8 438 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Adam32Q8K410 754 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Abhd11Q8K4F5 307 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Klrb1fQ8VD98 217 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ptbp2Q91Z31 531 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Aipl1Q924K1 328 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 MpstQ99J99 297 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rab28Q99KL7 221 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Pbld2Q9CXN7 288 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rhobtb1Q9DAK3 695 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Pin1Q9QUR7 165 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rai2Q9QVY8 529 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cdh17Q9R100 827 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fem1aaQ9Z2G1 654 aa13.39□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Znf711A2ANX9 761 aa13.38□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tgm7A2ART8 616 aa13.38□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ccdc13D3YV10 709 aa13.38□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Kcnk4O88454 398 aa13.38□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 P01665 111 aa13.38□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 P01666 111 aa13.38□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 H2-Q7P14429 334 aa13.38□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 H2-Q9P14431 200 aa13.38□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 BpgmP15327 259 aa13.38□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 EnpepP16406 945 aa13.38□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cr2P19070 1025 aa13.38□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gbp8Q2V6D6 525 aa13.38□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 SpertQ32MG2 446 aa13.38□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Nol9Q3TZX8 714 aa13.38□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tubal3Q3UX10 446 aa13.38□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gucy2fQ5SDA5 1108 aa13.38□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Kcna5Q61762 602 aa13.38□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Six3Q62233 333 aa13.38□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tmcc1Q69ZZ6 649 aa13.38□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rasgrp3Q6NZH9 691 aa13.38□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ssxb5Q6XAS2 159 aa13.38□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ube2r2Q6ZWZ2 238 aa13.38□□□□□ -0.27
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Olfr293Q7TS10 336 aa13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.8 ms