RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 BRMS1LQ5PSV4 323 aa20.12■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 KIAA1958Q8N8K9 716 aa20.12■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 NETO1Q8TDF5 533 aa20.12■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 DNAJB3Q8WWF6 145 aa20.12■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 PAAF1Q9BRP4 392 aa20.12■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 AGAP5A6NIR3 686 aa20.11■□□□□ 0.81
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PMS1-222ENST00000639501 ZNF404Q494X3 552 aa20.11■□□□□ 0.81
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PMS1-222ENST00000639501 C2orf69Q8N8R5 385 aa20.11■□□□□ 0.81
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PMS1-222ENST00000639501 ZNF181Q2M3W8 571 aa20.1■□□□□ 0.81
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PMS1-222ENST00000639501 MSH3P20585 1137 aa20.08■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 FADDQ13158 208 aa20.08■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 RFX4Q33E94 735 aa20.08■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 GDPD3Q7L5L3 318 aa20.08■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 LRRC49Q8IUZ0 686 aa20.08■□□□□ 0.81
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