RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621829.4

CLTC-215, Transcript of clathrin heavy chain, human

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene CLTC, Length 8,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLTC-215	ENST00000621829	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	LSAMP	Q13449	338 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	FBXO43	Q4G163	708 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	KLHL35	Q6PF15	583 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	TRMO	Q9BU70	441 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	INPPL1	O15357	1258 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	ACADM	P11310	421 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	MC4R	P32245	332 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	SYVN1	Q86TM6	617 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	ACVR2A	P27037	513 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	MAP2K4	P45985	399 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	ATP6V0D1	P61421	351 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	ARFRP1	Q13795	201 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	CARD16	Q5EG05	197 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	EGFR	P00533	1210 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	APLP1	P51693	650 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	CREB5	Q02930	508 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	SLC13A2	Q13183	592 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	PARG	Q86W56	976 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	ELP3	Q9H9T3	547 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	POMC	P01189	267 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	GPR89B	P0CG08	455 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	TMEM198	Q66K66	360 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	AP2M1	Q96CW1	435 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	SERPINB11	Q96P15	392 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	DUSP16	Q9BY84	665 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	EDNRA	P25101	427 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	AKT2	P31751	481 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	CHAF1B	Q13112	559 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	CAPN14	A8MX76	684 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	IFNA17	P01571	189 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	NOS2	P35228	1153 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	MAP3K8	P41279	467 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	OR12D2	P58182	307 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	HSPB3	Q12988	150 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	POU4F3	Q15319	338 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	ZACN	Q401N2	412 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	ZNF878	C9JN71	531 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	GTF2H2	Q13888	395 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	TTLL6	Q8N841	843 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	SEMA3C	Q99985	751 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	COPZ2	Q9P299	210 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	FBXO10	Q9UK96	956 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	TTLL8	A6PVC2	850 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	AIP	O00170	330 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	DLGAP1	O14490	977 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	ZNF286B	P0CG31	522 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	ZNF132	P52740	706 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	DYRK1A	Q13627	763 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	11.41	□□□□□ -0.58	1e-6	■■□□□ 13.3
CLTC-215	ENST00000621829	TMEM192	Q8IY95	271 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	IFT27	Q9BW83	186 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	POT1	Q9NUX5	634 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	ARPC2	O15144	300 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CLTC-215	ENST00000621829	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		11.4	□□□□□ -0.58

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