RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 GRM7Q14831 915 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 STARD3Q14849 445 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 POU4F3Q15319 338 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 CYS1Q717R9 158 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 TIGD4Q8IY51 512 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 BPIFB1Q8TDL5 484 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 ASB2Q96Q27 587 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 MMP27Q9H306 513 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 RRAGCQ9HB90 399 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 ACOT13Q9NPJ3 140 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 ERAP1Q9NZ08 941 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 LIMD1Q9UGP4 676 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 ASPDHA6ND91 283 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 OR2B3O76000 313 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 DIRAS1O95057 198 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 C1RP00736 705 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 APOA4P06727 396 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 CA5AP35218 305 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 NDUFV1P49821 464 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 RAB25P57735 213 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 BAK1Q16611 211 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF789Q5FWF6 425 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 SYPL2Q5VXT5 272 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 FAM217AQ8IXS0 508 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 OR8H3Q8N146 312 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 MIER2Q8N344 545 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 ZBTB44Q8NCP5 570 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 DNAJB3Q8WWF6 145 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 FBXW5Q969U6 566 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 SIPA1Q96FS4 1042 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 OR2A14Q96R47 310 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 HBEGFQ99075 208 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 NMRK2Q9NPI5 230 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF639Q9UID6 485 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1B0GTL3 188 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 FAM92AA1XBS5 289 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 FZD9O00144 591 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 PLD2O14939 933 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 TLL1O43897 1013 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 SLITRK5O94991 958 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 STMN1P16949 149 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 CFL1P23528 166 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 RPS12P25398 132 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 KCNC1P48547 511 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 UFM1P61960 85 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 MFSD10Q14728 455 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 RIOX2Q8IUF8 465 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 DEFB106AQ8N104 65 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 MINDY1Q8N5J2 469 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM40Q8WWA1 233 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 ISL2Q96A47 359 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 RIPOR3Q96MK2 946 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 GPR22Q99680 433 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 ATXN3LQ9H3M9 355 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 ALG9Q9H6U8 611 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 GABRQQ9UN88 632 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 SSC5DA1L4H1 1573 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 SMIM30A4D0T7 59 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 MDM4O15151 490 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 SHOXO15266 292 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 RGS10O43665 173 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 CLCN7P51798 805 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 GABARAPL2P60520 117 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 DSTNP60981 165 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 RAB10P61026 200 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 UBE3AQ05086 875 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 MGAT3Q09327 533 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 FAPQ12884 760 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 BTN1A1Q13410 526 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 FLYWCH1Q4VC44 716 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 ARMCX2Q7L311 632 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 RIMKLAQ8IXN7 391 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-211ENST00000618610 SLC2A14Q8TDB8 520 aa8.05□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms