RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 PTPN7P35236 360 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 RRADP55042 308 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 SERPINA9Q86WD7 417 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 TC2NQ8N9U0 490 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 SSC4DQ8WTU2 575 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 MFRPQ9BY79 579 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 OSBPL8Q9BZF1 889 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 XKR8Q9H6D3 395 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 GPR83Q9NYM4 423 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 ACTR10Q9NZ32 417 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 HBQ1P09105 142 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 PTMSP20962 102 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 AGXTP21549 392 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 PRKG2Q13237 762 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 ATP1A4Q13733 1029 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 SPARCL1Q14515 664 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 SLC6A19Q695T7 634 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF449Q6P9G9 518 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 CLDN19Q8N6F1 224 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 PNPLA2Q96AD5 504 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 FAM118BQ9BPY3 351 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 HGH1Q9BTY7 390 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 DHRS4Q9BTZ2 278 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 SLAMF7Q9NQ25 335 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 LUZP4Q9P127 313 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 TCP11X1B4DZS4 312 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 C9J4A7 227 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 H7C0S8 307 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 CTNNA2P26232 953 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 SPESP1Q6UW49 350 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 MICALCLQ6ZW33 695 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 RAB43Q86YS6 212 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC170Q8IYT3 715 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 PADI2Q9Y2J8 665 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 PCSK5Q92824 1860 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 CENPEQ02224 2701 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 GSTM1P09488 218 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 PRSS56P0CW18 603 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 VARSP26640 1264 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 GSTM4Q03013 218 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 SPA17Q15506 151 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 TAS2R42Q7RTR8 314 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 PIANPQ8IYJ0 282 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 GPR135Q8IZ08 494 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 RNF214Q8ND24 703 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC45Q96CN5 670 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 SGSM3Q96HU1 749 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 TSPY26PQ9H489 355 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 FAM60AQ9NP50 221 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 ICKQ9UPZ9 632 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 H3BMH7 237 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 RNF224P0DH78 156 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 KCTD11Q693B1 232 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 TCTN2Q96GX1 697 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 C17orf62Q9BQA9 187 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 C5AR2Q9P296 337 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 AP2A2O94973 939 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 OTX2P32243 289 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 RAPSNQ13702 412 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 SSPNQ14714 243 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 UNC5AQ6ZN44 842 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 MRGPREQ86SM8 312 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 HOOK3Q86VS8 718 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 OR5AR1Q8NGP9 310 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 IP6K3Q96PC2 410 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 SLC29A3Q9BZD2 475 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 FER1L5A0AVI2 2057 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 ITPR2Q14571 2701 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 HCRTR1O43613 425 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 OR2B3O76000 313 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRF-216ENST00000617451 TJP3O95049 919 aa24.08■■□□□ 1.45
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