RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	CLDN14	O95500	239 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	PLA2G4B	P0C869	781 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	GJB2	P29033	226 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ALDH4A1	P30038	563 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	LHX1	P48742	406 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	SGSH	P51688	502 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ARHGEF7	Q14155	803 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF235	Q14590	738 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	LLGL1	Q15334	1064 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ASIC2	Q16515	512 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	KYNU	Q16719	465 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	XKRX	Q6PP77	449 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	HORMAD1	Q86X24	394 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	BMPER	Q8N8U9	685 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	WASF1	Q92558	559 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	KIFAP3	Q92845	792 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	BICD1	Q96G01	975 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	KCNK16	Q96T55	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	GPR83	Q9NYM4	423 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	HESX1	Q9UBX0	185 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	APPL1	Q9UKG1	709 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CDH9	Q9ULB4	789 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768		A0A088AWK7	358 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	PP2D1	A8MPX8	630 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768		A8MU76	341 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768		B4DGG1	531 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768		B4E171	279 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	OGT	O15294	1046 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	SLC7A4	O43246	635 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	FAM189A1	O60320	539 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	NEMF	O60524	1076 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	JRK	O75564	520 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	CEACAM4	O75871	244 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	ONECUT2	O95948	504 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	ADRB2	P07550	413 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	XBP1	P17861	261 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	CSK	P41240	450 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	TSPAN7	P41732	249 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	LIMK2	P53671	638 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	LOXL3	P58215	753 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	DNASE1L3	Q13609	305 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	CALCRL	Q16602	461 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	FAM153C	Q494X1	144 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	ICE2	Q659A1	982 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	SLC35A4	Q96G79	324 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF559	Q9BR84	538 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	ACTL8	Q9H568	366 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	NMUR1	Q9HB89	426 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	MED16	Q9Y2X0	877 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	NME7	Q9Y5B8	376 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	ZAN	Q9Y493	2812 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768		H3BUI4	141 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	ZWINT	O95229	277 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64

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