RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 PYROXD1Q8WU10 500 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 IFT81Q8WYA0 676 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 USP7Q93009 1102 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ART4Q93070 314 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRC39Q96DD0 335 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CERS2Q96G23 380 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ZDHHC12Q96GR4 267 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 C9orf72Q96LT7 481 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM167BQ9BTA0 163 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 HGH1Q9BTY7 390 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC68Q9H2F9 335 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 SRMSQ9H3Y6 488 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 MVB12BQ9H7P6 319 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 PLAC1Q9HBJ0 212 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 WDR70Q9NW82 654 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC39A1Q9NY26 324 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 PDP2Q9P2J9 529 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC17A6Q9P2U8 582 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 PLAGL1Q9UM63 463 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CDYLQ9Y232 598 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 LOXL2Q9Y4K0 774 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 NFS1Q9Y697 457 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 SPTBN2O15020 2390 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ESYT3A0FGR9 886 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 GSAPA4D1B5 854 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM8BA6NDV4 472 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 OR5K3A6NET4 321 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 E7ESA3 106 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 H3BMM5 538 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 BTN3A3O00478 584 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 PIAS1O75925 651 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 SLCO2B1O94956 709 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 C9P02748 559 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 TPBGLP0DKB5 382 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 THRAP10827 490 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 GABRB3P28472 473 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC5A2P31639 672 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 MAGEA4P43358 317 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ADARP55265 1226 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 PRKAA1Q13131 559 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 KLHL38Q2WGJ6 581 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ACSBG2Q5FVE4 666 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 STEAP4Q687X5 459 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 TTC23LQ6PF05 361 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ZDHHC24Q6UX98 284 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 AMIGO1Q86WK6 493 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 OOSP2Q86WS3 158 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM129CQ86XR2 697 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC22A15Q8IZD6 547 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ZBTB2Q8N680 514 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CEP112Q8N8E3 955 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 OR5K2Q8NHB8 316 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 FBXO25Q8TCJ0 367 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 INPP5DQ92835 1189 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 FGF11Q92914 225 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 RNF31Q96EP0 1072 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 NDNQ99608 321 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 GPR21Q99679 349 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC30A3Q99726 388 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 MAP3K3Q99759 626 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CTRCQ99895 268 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 EPHA6Q9UF33 1036 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 POLG2Q9UHN1 485 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 RAXQ9Y2V3 346 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 DHRS7Q9Y394 339 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 KNTC1P50748 2209 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CDRT15L2A8MXV6 281 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ISM1B1AKI9 464 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 BTN3A1O00481 513 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 PRAMEF10O60809 474 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 VPS26AO75436 327 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 C1orf105O95561 183 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 SAT1P21673 171 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CDH3P22223 829 aa6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms