RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586268.5

NEDD4L-215, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-215	ENST00000586268	GGT5	P36269	586 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	CCR10	P46092	362 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	AGTR2	P50052	363 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	HNMT	P50135	292 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	ABR	Q12979	859 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	METRNL	Q641Q3	311 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	CUZD1	Q86UP6	607 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	STON2	Q8WXE9	905 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	FBXL8	Q96CD0	374 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	FAR2	Q96K12	515 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	OR2M4	Q96R27	311 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	KCNK13	Q9HB14	408 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	GPR27	Q9NS67	375 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	PNPO	Q9NVS9	261 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	ARL15	Q9NXU5	204 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268		H0Y8X5	98 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	E2F3	O00716	465 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	C1orf105	O95561	183 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	MLYCD	O95822	493 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	KIT	P10721	976 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	ACP5	P13686	325 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	AOC1	P19801	751 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	THOP1	P52888	689 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	ARFIP2	P53365	341 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	CLC	Q05315	142 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	LCP2	Q13094	533 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	PTK2B	Q14289	1009 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268		Q6ZSR6	202 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	FRMD1	Q8N878	549 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	ATL1	Q8WXF7	558 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	CD244	Q9BZW8	370 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	KL	Q9UEF7	1012 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268		A0A0G2JND7	137 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	MATN2	O00339	956 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	HDAC3	O15379	428 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	DCX	O43602	365 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	CD27	P26842	260 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	BDKRB1	P46663	353 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	GNPDA1	P46926	289 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	SLC6A12	P48065	614 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	PIK3CG	P48736	1102 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	HSPA7	P48741	367 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	CLCNKA	P51800	687 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	CDH13	P55290	713 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	PKNOX1	P55347	436 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	LRP8	Q14114	963 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	ZSCAN26	Q16670	478 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	OR13H1	Q8NG92	308 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	AGAP11	Q8TF27	550 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	PDXP	Q96GD0	296 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	CCDC138	Q96M89	665 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	ZNF382	Q96SR6	550 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	WWP1	Q9H0M0	922 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NEDD4L-215	ENST00000586268	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23

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