RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583282.5

GGA3-216, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-216	ENST00000583282	LILRA5	A6NI73	299 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	MPC1L	P0DKB6	136 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	CBSL	P0DN79	551 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	TYRP1	P17643	537 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	NDUFS1	P28331	727 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	CSF2RB	P32927	897 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	CBS	P35520	551 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	SERPINB9	P50453	376 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	RAB10	P61026	200 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	CCL7	P80098	99 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	RSC1A1	Q92681	617 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	IL17F	Q96PD4	163 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	XKR8	Q9H6D3	395 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-216	ENST00000583282	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	DUX1	O43812	170 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	KRT38	O76015	456 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	TSPAN12	O95859	305 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	RPN2	P04844	631 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	ID4	P47928	161 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	IL2	P60568	153 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	IRF9	Q00978	393 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	CSHL1	Q14406	222 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	NR1D2	Q14995	579 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	MREG	Q8N565	214 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	CCDC77	Q9BR77	488 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	ABCG4	Q9H172	646 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	VPS11	Q9H270	941 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	RDH14	Q9HBH5	336 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	ICK	Q9UPZ9	632 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	PLAA	Q9Y263	795 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	PIEZO1	Q92508	2521 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282		A0A1W2PQM1	296 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	CCDC151	A5D8V7	595 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	AGRP	O00253	132 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	BTN3A1	O00481	513 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	KRT37	O76014	449 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	UBXN7	O94888	489 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	C1orf105	O95561	183 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	PROS1	P07225	676 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	GP1BA	P07359	652 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	AMD1	P17707	334 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	CD9	P21926	228 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	PPP1CA	P62136	330 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	SPIDR	Q14159	915 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	HES3	Q5TGS1	186 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	LCN9	Q8WX39	176 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	EXT2	Q93063	718 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	KLHL3	Q9UH77	587 aa		13.63	□□□□□ -0.23

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