RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 RDH14Q9HBH5 336 aa32.24■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 MCM3P25205 808 aa32.23■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPRP35270 261 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 LIMK2P53671 638 aa32.23■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 CPNE9Q8IYJ1 553 aa32.23■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa32.23■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 CFAP61Q8NHU2 1237 aa32.23■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 DPYSL5Q9BPU6 564 aa32.23■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 MATN4O95460 622 aa32.22■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABHD2P08910 425 aa32.22■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 JUPP14923 745 aa32.22■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 AMD1P17707 334 aa32.22■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAPK9P45984 424 aa32.22■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRKG2Q13237 762 aa32.22■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa32.22■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 PAQR3Q6TCH7 311 aa32.22■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 USP53Q70EK8 1073 aa32.22■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEPDC7Q96QD5 511 aa32.22■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 RIPK2O43353 540 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 PROS1P07225 676 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 RGS4P49798 205 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLHL35Q6PF15 583 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR52E1Q8NGJ3 308 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR22Q99680 433 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUDT22Q9BRQ3 303 aa32.21■■■□□ 2.75
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 WASF3Q9UPY6 502 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 NFS1Q9Y697 457 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 TYRP1P17643 537 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 SAT1P21673 171 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 CSF2RBP32927 897 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 CAPZBP47756 277 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 POU4F1Q01851 419 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 NCSTNQ92542 709 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZMYND15Q9H091 742 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 KDM1AO60341 852 aa32.2■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM155BO75949 473 aa32.2■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 MPC1LP0DKB6 136 aa32.2■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 CFHR1Q03591 330 aa32.2■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa32.2■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 LCN9Q8WX39 176 aa32.2■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP32.2■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 RSC1A1Q92681 617 aa32.2■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM221BA6H8Z2 402 aa32.19■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 C1orf105O95561 183 aa32.19■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCNFP41002 786 aa32.19■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDX1P52945 283 aa32.19■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC12A2P55011 1212 aa32.19■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 TAS2R39P59534 338 aa32.19■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 ISXQ2M1V0 245 aa32.19■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM71Q6P5X7 295 aa32.19■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 TTC23LQ6PF05 361 aa32.19■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPNS2Q8IVW8 549 aa32.19■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4D9Q8NGE8 314 aa32.19■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC39A10Q9ULF5 831 aa32.19■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 ITGA2BP08514 1039 aa32.18■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL2P60568 153 aa32.18■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYHR1Q6ZMK1 362 aa32.18■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLXDC1Q8IUK5 500 aa32.18■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAGEC3Q8TD91 643 aa32.18■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa32.18■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRAMD1AQ96CP6 724 aa32.18■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM74Q96NL1 305 aa32.18■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCNM1Q9BWG6 230 aa32.18■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB33BQ9H082 229 aa32.18■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 SRMSQ9H3Y6 488 aa32.18■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 POPDC3Q9HBV1 291 aa32.18■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM149AA5PLN7 773 aa32.17■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 CSO75390 466 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 PGGT1BP53609 377 aa32.17■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP32.17■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 OOSP2Q86WS3 158 aa32.17■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLITRK4Q8IW52 837 aa32.17■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4E2Q8NGC2 313 aa32.17■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC44A1Q8WWI5 657 aa32.17■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 NCOR2Q9Y618 2525 aa32.17■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 USP10Q14694 798 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 CEP97Q8IW35 865 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAD51AP1Q96B01 352 aa32.16■■■□□ 2.74
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