RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 PPM1MQ96MI6 270 aa18.08■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 PANX3Q96QZ0 392 aa18.08■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 MAP3K3Q99759 626 aa18.08■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 PLAC1Q9HBJ0 212 aa18.08■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 GALPQ9UBC7 116 aa18.08■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 ACSL6Q9UKU0 697 aa18.08■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa18.08■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 SLCO2B1O94956 709 aa18.07■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 ESR1P03372 595 aa18.07■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 ERVK-10P10266 1014 aa18.07■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 ELK3P41970 407 aa18.07■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 ADARP55265 1226 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 TMED2Q15363 201 aa18.07■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 DCAF12Q5T6F0 453 aa18.07■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 ARMC6Q6NXE6 501 aa18.07■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa18.07■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 OTOAQ7RTW8 1153 aa18.07■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 KCNMB4Q86W47 210 aa18.07■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 AMIGO1Q86WK6 493 aa18.07■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 TBC1D21Q8IYX1 336 aa18.07■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 OR5K2Q8NHB8 316 aa18.07■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 CFAP61Q8NHU2 1237 aa18.07■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 DDA1Q9BW61 102 aa18.07■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 DPH1Q9BZG8 443 aa18.07■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 B3GNT4Q9C0J1 378 aa18.07■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 DPH5Q9H2P9 285 aa18.07■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 FBXO8Q9NRD0 319 aa18.07■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 WDR70Q9NW82 654 aa18.07■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 PLAGL1Q9UM63 463 aa18.07■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 ICKQ9UPZ9 632 aa18.07■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 CHMP2BQ9UQN3 213 aa18.07■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM187AA6NFU0 413 aa18.06■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 SMAPO00193 183 aa18.06■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 BTN3A1O00481 513 aa18.06■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 PKMP14618 531 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 CHRM3P20309 590 aa18.06■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 RAB15P59190 212 aa18.06■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 MPP1Q00013 466 aa18.06■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 FOXM1Q08050 763 aa18.06■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 KCNAB1Q14722 419 aa18.06■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 HIF1AQ16665 826 aa18.06■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 SPANXN3Q5MJ09 141 aa18.06■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF549Q6P9A3 640 aa18.06■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 SPNS2Q8IVW8 549 aa18.06■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 RNF31Q96EP0 1072 aa18.06■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 CFAP36Q96G28 342 aa18.06■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 ERP44Q9BS26 406 aa18.06■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa18.06■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 SEMA5BQ9P283 1151 aa18.06■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 CIDEBQ9UHD4 219 aa18.06■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 POLG2Q9UHN1 485 aa18.06■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 FBXO5Q9UKT4 447 aa18.06■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa18.06■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 GSAPA4D1B5 854 aa18.05■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 TLCD2A6NGC4 264 aa18.05■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 H3BMM5 538 aa18.05■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 KPNA5O15131 536 aa18.05■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 URI1O94763 535 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 HAUS5O94927 633 aa18.05■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 TTC4O95801 387 aa18.05■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 NELFEP18615 380 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 ARL4CP56559 192 aa18.05■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 PRKAA1Q13131 559 aa18.05■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa18.05■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 UNC5AQ6ZN44 842 aa18.05■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 MAATS1Q7Z4T9 603 aa18.05■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 ANKMY2Q8IV38 441 aa18.05■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 LMNTD2Q8IXW0 634 aa18.05■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa18.05■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 CALML6Q8TD86 181 aa18.05■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 UBXN4Q92575 508 aa18.05■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF592Q92610 1267 aa18.05■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC41A2Q96JW4 573 aa18.05■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 OR6C1Q96RD1 312 aa18.05■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 CD180Q99467 661 aa18.05■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM167BQ9BTA0 163 aa18.05■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 NAT9Q9BTE0 207 aa18.05■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 CDC23Q9UJX2 597 aa18.05■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 POMT2Q9UKY4 750 aa18.05■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 TEX264Q9Y6I9 313 aa18.05■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 LIPCP11150 499 aa18.04■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 FOLR1P15328 257 aa18.04■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 CD82P27701 267 aa18.04■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
GCSHP2-201ENST00000560971 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms