RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	GAS1	P54826	345 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	UCP2	P55851	309 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP10-3	P60369	221 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ECT2L	Q008S8	904 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ACSM1	Q08AH1	577 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	DMWD	Q09019	674 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ABR	Q12979	859 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SNX1	Q13596	522 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	VWC2	Q2TAL6	325 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	MANEA	Q5SRI9	462 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT39	Q6A163	491 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	GHDC	Q8N2G8	530 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	AMER3	Q8N944	861 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	EXD3	Q8N9H8	876 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SCAI	Q8N9R8	606 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	BBS10	Q8TAM1	723 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ST7L	Q8TDW4	575 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	THRSP	Q92748	146 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SPSB1	Q96BD6	273 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF558	Q96NG5	402 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	FRG2B	Q96QU4	278 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SEMA3C	Q99985	751 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	FZD8	Q9H461	694 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CENPM	Q9NSP4	180 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	UPB1	Q9UBR1	384 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	DHDH	Q9UQ10	334 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PPM1	405 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CFAP73	A6NFT4	308 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957		M0QX08	132 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	EBAG9	O00559	213 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PTGES	O14684	152 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	GMFG	O60234	142 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	GPRIN2	O60269	458 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	UGDH	O60701	494 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	AKR7A3	O95154	331 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNK5	O95279	499 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	MOCS3	O95396	460 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ADCY5	O95622	1261 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	AK1	P00568	194 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TGFA	P01135	160 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	WNT1	P04628	370 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	DANCR	P0C864	163 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CTAGE8	P0CG41	777 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	THRB	P10828	461 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PCNA	P12004	261 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	VPREB1	P12018	145 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC2A4	P14672	509 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	GJA1	P17302	382 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	NR2F2	P24468	414 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ARRB2	P32121	409 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC8A1	P32418	973 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	HSPA1L	P34931	641 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	STAT6	P42226	847 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPN9	P43378	593 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97

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