RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 OR5H15A6NDH6 313 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 NPIPA5E9PKD4 350 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 H3BRJ5 948 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 PES1O00541 588 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 PROM1O43490 865 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 PRPSAP2O60256 369 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 RNF8O76064 485 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 PEX11BO96011 259 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 PVRP15151 417 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 MSX1P28360 303 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 CHRNB4P30926 498 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 SPAM1P38567 509 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 CTSCP53634 463 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 ARSFP54793 590 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 CDR2Q01850 454 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 DSC2Q02487 901 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 KEAP1Q14145 624 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 CA9Q16790 459 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 SLC5A12Q1EHB4 618 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 FBXW10Q5XX13 1052 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM211Q6ICI0 200 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 NAPRTQ6XQN6 538 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 CEP128Q6ZU80 1094 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 OVCH1Q7RTY7 1134 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 C11orf96Q7Z7L8 435 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 ACVR1CQ8NER5 493 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 CRB3Q9BUF7 120 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 PITPNM3Q9BZ71 974 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 LIME1Q9H400 295 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 LRFN1Q9P244 771 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 FAM8A1Q9UBU6 413 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 PCSK1NQ9UHG2 260 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 TEKT2Q9UIF3 430 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 NPIPA1Q9UND3 350 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 ABCA4P78363 2273 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 ACANP16112 2415 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 CSPG4Q6UVK1 2322 aa9.31□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 A0A1B0GX78 115 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 ANKRD66B4E2M5 251 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 BTN3A1O00481 513 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 LY6G6DO95868 133 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 WDPCPO95876 746 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 PRR35P0CG20 571 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 CXCR2P25025 360 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 PSMA2P25787 234 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 SOX11P35716 441 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 HCAR3P49019 387 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF165P49910 485 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 NKG7Q16617 165 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF766Q5HY98 468 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 TTLL10Q6ZVT0 673 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 FAM20CQ8IXL6 584 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 MBD6Q96DN6 1003 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 VPS35Q96QK1 796 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 RNF32Q9H0A6 362 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 TAS2R14Q9NYV8 317 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 ACSL5Q9ULC5 683 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 SHOC2Q9UQ13 582 aa9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 KLHL33A6NCF5 533 aa9.29□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 OR2AG2A6NM03 316 aa9.29□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 F8VZ95 297 aa9.29□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 CTAG2O75638 210 aa9.29□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 BMP10O95393 424 aa9.29□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 RAF1P04049 648 aa9.29□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 TMPRSS15P98073 1019 aa9.29□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 OCA2Q04671 838 aa9.29□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF33BQ06732 778 aa9.29□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 OLIG2Q13516 323 aa9.29□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 QPCTQ16769 361 aa9.29□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 DEFB113Q30KQ7 82 aa9.29□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 METRNLQ641Q3 311 aa9.29□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM220Q6QAJ8 160 aa9.29□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 NLRP9Q7RTR0 991 aa9.29□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 DOLPP1Q86YN1 238 aa9.29□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 RND1Q92730 232 aa9.29□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 FERD3LQ96RJ6 166 aa9.29□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 DMRTA2Q96SC8 542 aa9.29□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 SPSB2Q99619 263 aa9.29□□□□□ -0.92
SMAD3-211ENST00000559460 NEUROD4Q9HD90 331 aa9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms