RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545663.5

CLSTN3-216, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 533 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-216ENST00000545663 SPSB2Q99619 263 aa14.81□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 UCK2Q9BZX2 261 aa14.81□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 ZNF358Q9NW07 568 aa14.81□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 TTLL3Q9Y4R7 772 aa14.81□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 ANKRD62A6NC57 917 aa14.8□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 ANKRD66B4E2M5 251 aa14.8□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 FAM227AF5H4B4 570 aa14.8□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 BTN3A1O00481 513 aa14.8□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 MAP3K7O43318 606 aa14.8□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 ZWINTO95229 277 aa14.8□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 WDPCPO95876 746 aa14.8□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 INHBBP09529 407 aa14.8□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 UCHL3P15374 230 aa14.8□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 GABRA4P48169 554 aa14.8□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 HCAR3P49019 387 aa14.8□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 RPL26P61254 145 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 DSG2Q14126 1118 aa14.8□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 NKG7Q16617 165 aa14.8□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa14.8□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 FAM182AQ5T1J6 154 aa14.8□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 CES4AQ5XG92 561 aa14.8□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 METRNLQ641Q3 311 aa14.8□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 MON1BQ7L1V2 547 aa14.8□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 TRIM73Q86UV7 250 aa14.8□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 DOLPP1Q86YN1 238 aa14.8□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 GDAP1Q8TB36 358 aa14.8□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 DMRTA2Q96SC8 542 aa14.8□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 STK33Q9BYT3 514 aa14.8□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 TSPY26PQ9H489 355 aa14.8□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 TXLNGQ9NUQ3 528 aa14.8□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 FAM8A1Q9UBU6 413 aa14.8□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 OR2AG2A6NM03 316 aa14.79□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa14.79□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 CALB1P05937 261 aa14.79□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 HEXAP06865 529 aa14.79□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 ALAS2P22557 587 aa14.79□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 DCDC1P59894 354 aa14.79□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 TFF3Q07654 80 aa14.79□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 MYBPHQ13203 477 aa14.79□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 PCOLCEQ15113 449 aa14.79□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 RBBP7Q16576 425 aa14.79□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa14.79□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 PDPK2PQ6A1A2 396 aa14.79□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 DCUN1D2Q6PH85 259 aa14.79□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 TMCO3Q6UWJ1 677 aa14.79□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 OVCH1Q7RTY7 1134 aa14.79□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 LRRN4Q8WUT4 740 aa14.79□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 C8orf44Q96CB5 159 aa14.79□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 SRMSQ9H3Y6 488 aa14.79□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 ADAM21Q9UKJ8 722 aa14.79□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 PPT2Q9UMR5 302 aa14.79□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 TLN2Q9Y4G6 2542 aa14.79□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 FOXO6A8MYZ6 492 aa14.78□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 KCNJ13O60928 360 aa14.78□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 LY6G6DO95868 133 aa14.78□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 CELA2AP08217 269 aa14.78□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 HSF1Q00613 529 aa14.78□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 GTF2H3Q13889 308 aa14.78□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 ALG1LQ6GMV1 187 aa14.78□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 TMEM220Q6QAJ8 160 aa14.78□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 TMC3Q7Z5M5 1100 aa14.78□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 CCDC110Q8TBZ0 833 aa14.78□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 LCN9Q8WX39 176 aa14.78□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 GPR137Q96N19 417 aa14.78□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 ALPK1Q96QP1 1244 aa14.78□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 BPIFA1Q9NP55 256 aa14.78□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP14.78□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 CTSFQ9UBX1 484 aa14.78□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 KCNN3Q9UGI6 736 aa14.78□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 HCFC1P51610 2035 aa14.78□□□□□ -0.04
CLSTN3-216ENST00000545663 FAM90A27PA6NNH2 459 aa14.77□□□□□ -0.05
CLSTN3-216ENST00000545663 GPR39O43194 453 aa14.77□□□□□ -0.05
CLSTN3-216ENST00000545663 PRPSAP2O60256 369 aa14.77□□□□□ -0.05
CLSTN3-216ENST00000545663 TOXO94900 526 aa14.77□□□□□ -0.05
CLSTN3-216ENST00000545663 PRAMEF1O95521 474 aa14.77□□□□□ -0.05
CLSTN3-216ENST00000545663 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CLSTN3-216ENST00000545663 MMP2P08253 660 aa14.77□□□□□ -0.05
CLSTN3-216ENST00000545663 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CLSTN3-216ENST00000545663 PSMA2P25787 234 aa14.77□□□□□ -0.05
CLSTN3-216ENST00000545663 MIPP30301 263 aa14.77□□□□□ -0.05
CLSTN3-216ENST00000545663 OLIG2Q13516 323 aa14.77□□□□□ -0.05
CLSTN3-216ENST00000545663 KRT33BQ14525 404 aa14.77□□□□□ -0.05
CLSTN3-216ENST00000545663 COX15Q7KZN9 410 aa14.77□□□□□ -0.05
CLSTN3-216ENST00000545663 KBTBD2Q8IY47 623 aa14.77□□□□□ -0.05
CLSTN3-216ENST00000545663 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CLSTN3-216ENST00000545663 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CLSTN3-216ENST00000545663 RMDN2Q96LZ7 410 aa14.77□□□□□ -0.05
CLSTN3-216ENST00000545663 TTC25Q96NG3 672 aa14.77□□□□□ -0.05
CLSTN3-216ENST00000545663 NDST4Q9H3R1 872 aa14.77□□□□□ -0.05
CLSTN3-216ENST00000545663 XKR8Q9H6D3 395 aa14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms