RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 TMEM202A6NGA9 273 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 OR6C75A6NL08 312 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 ERVV-2B6SEH9 535 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 F8VZ95 297 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 J3KR12 359 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 O00370 1275 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 PES1O00541 588 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 TIMM23O14925 209 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 RAD51CO43502 376 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 GFPT2O94808 682 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 MOCS3O95396 460 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 BAG3O95817 575 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 VIMP08670 466 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 FAM90A13PP0C7W8 464 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 FAM90A24PP0C7X0 464 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 MYL6BP14649 208 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 FERP16591 822 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 CD58P19256 250 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 PAX7P23759 505 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 CASP1P29466 404 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 PIGAP37287 484 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 PRKCIP41743 596 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 MAGEA1P43355 309 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
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TRDN-204ENST00000542443 F2RL1P55085 397 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 ABATP80404 500 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 LRRC63Q05C16 580 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 Q0VFX4 171 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 BNIP1Q12981 228 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 SLC39A6Q13433 755 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 ZCWPW2Q504Y3 356 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 ANKRD54Q6NXT1 300 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 ZNF549Q6P9A3 640 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 MFSD6Q6ZSS7 791 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 MTSS1LQ765P7 747 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
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TRDN-204ENST00000542443 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 SCCPDHQ8NBX0 429 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 CCDC197Q8NCU1 140 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 AGBL3Q8NEM8 1001 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 ITFG2Q969R8 447 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 CHMP6Q96FZ7 201 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
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TRDN-204ENST00000542443 CAMK1GQ96NX5 476 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
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TRDN-204ENST00000542443 DCLK3Q9C098 648 aa5.01□□□□□ -1.61
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TRDN-204ENST00000542443 TFR2Q9UP52 801 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 ASB3Q9Y575 518 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 STON1Q9Y6Q2 735 aa5.01□□□□□ -1.61
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TRDN-204ENST00000542443 A0A1B0GUL6 1792 aa5.01□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa5□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 A0A1B0GVM2 712 aa5□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 TRIM49BA6NDI0 452 aa5□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 PRSS47A8MTI9 375 aa5□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 B4DLN1 442 aa5□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 SNX3O60493 162 aa5□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 FLOT1O75955 427 aa5□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 NOL4O94818 638 aa5□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 NKX2-2O95096 273 aa5□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 VNN2O95498 520 aa5□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 SERPING1P05155 500 aa5□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 RARGP13631 454 aa5□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 KRT10P13645 584 aa5□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 CCNB1P14635 433 aa5□□□□□ -1.61
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TRDN-204ENST00000542443 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 ARRB2P32121 409 aa5□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 NCALDP61601 193 aa5□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 SORDQ00796 357 aa5□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 GUCY2DQ02846 1103 aa5□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 NAE1Q13564 534 aa5□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 ACVR2BQ13705 512 aa5□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 PDIA5Q14554 519 aa5□□□□□ -1.61
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TRDN-204ENST00000542443 PARP6Q2NL67 630 aa5□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 CCDC57Q2TAC2 916 aa5□□□□□ -1.61
TRDN-204ENST00000542443 KCTD16Q68DU8 428 aa5□□□□□ -1.61
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