RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533249.5

PKP3-210, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 3

Gene PKP3, Length 1,111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-210ENST00000533249 PITPNM3Q9BZ71 974 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP3-210ENST00000533249 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PKP3-210ENST00000533249 MVB12BQ9H7P6 319 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP3-210ENST00000533249 VPS37BQ9H9H4 285 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP3-210ENST00000533249 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PKP3-210ENST00000533249 EFR3BQ9Y2G0 817 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP3-210ENST00000533249 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP3-210ENST00000533249 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 C2orf74A8MZ97 194 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 VAV2P52735 878 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 FHL5Q5TD97 284 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 AADACL2Q6P093 401 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 RAD9BQ6WBX8 426 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 AMIGO1Q86WK6 493 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 CLDN19Q8N6F1 224 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 LRRC45Q96CN5 670 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 NUDT9Q9BW91 350 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 ARNT2Q9HBZ2 717 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 ICE1Q9Y2F5 2266 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 E7EQ34 232 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 ZNF749O43361 778 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 CEACAM4O75871 244 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 MSL3P1P0C860 447 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 ATXN8OSP0DMR3 200 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 TPH1P17752 444 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 ACRV1P26436 265 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 CD151P48509 253 aa22.13■■□□□ 1.13
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PKP3-210ENST00000533249 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 NCF4Q15080 339 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 C4orf17Q53FE4 359 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 ZBTB2Q8N680 514 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 C19orf43Q9BQ61 176 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 KCNF1Q9H3M0 494 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 ACTR10Q9NZ32 417 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 SEC16AO15027 2179 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 SHANK1Q9Y566 2161 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 RCCD1A6NED2 376 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 C9J4A7 227 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 DPM1O60762 260 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 PTPN7P35236 360 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 CETN2P41208 172 aa22.12■■□□□ 1.13
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PKP3-210ENST00000533249 ATP1A4Q13733 1029 aa22.12■■□□□ 1.13
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PKP3-210ENST00000533249 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 KIAA1328Q86T90 577 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 TRIM73Q86UV7 250 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 HOOK3Q86VS8 718 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 TXLNBQ8N3L3 684 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
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PKP3-210ENST00000533249 MAP10Q9P2G4 905 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 TJP3O95049 919 aa22.11■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 AGXTP21549 392 aa22.11■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 OTX2P32243 289 aa22.11■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 SPESP1Q6UW49 350 aa22.11■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa22.11■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 MED25Q71SY5 747 aa22.11■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 GPR135Q8IZ08 494 aa22.11■■□□□ 1.13
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PKP3-210ENST00000533249 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 GPR83Q9NYM4 423 aa22.11■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa22.11■■□□□ 1.13
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PKP3-210ENST00000533249 DUSP10Q9Y6W6 482 aa22.11■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 ESPL1Q14674 2120 aa22.1■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 CCDC78A2IDD5 438 aa22.1■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 H7C0S8 307 aa22.1■■□□□ 1.13
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PKP3-210ENST00000533249 DBN1Q16643 649 aa22.1■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 DEFB110Q30KQ9 67 aa22.1■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 RAB43Q86YS6 212 aa22.1■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa22.1■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 PIANPQ8IYJ0 282 aa22.1■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 GLIS1Q8NBF1 620 aa22.1■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 OR5AR1Q8NGP9 310 aa22.1■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 PCSK5Q92824 1860 aa22.1■■□□□ 1.13
PKP3-210ENST00000533249 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa22.1■■□□□ 1.13
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