RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 UBL4AP11441 157 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 PDX1P52945 283 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 CX3CL1P78423 397 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 DMPKQ09013 629 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 XKR3Q5GH77 459 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACSM2BQ68CK6 577 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 TSPAN33Q86UF1 283 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC25A42Q86VD7 318 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 KIRREL3Q8IZU9 778 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPD1LQ8N335 351 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPFIBP2Q8ND30 876 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 METTL6Q8TCB7 284 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNG4Q8TDN1 519 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM81BQ96LP2 452 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 HHATLQ9HCP6 504 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 NPAP1Q9NZP6 1156 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 OSGIN1Q9UJX0 560 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A1W2PQF6 199 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 TGFB1I1O43294 461 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPRIN2O60269 458 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 THEGLP0DJG4 465 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 HSD3B1P14060 373 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 XBP1P17861 261 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 OXTRP30559 389 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 RHBDL3P58872 404 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 CYP20A1Q6UW02 462 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 KIF6Q6ZMV9 814 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 BTN2A1Q7KYR7 527 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZBED8Q8IZ13 594 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 ABHD12Q8N2K0 398 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAPK15Q8TD08 544 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNF128Q8TEB7 428 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 LRRC15Q8TF66 581 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 CHPT1Q8WUD6 406 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 MOAP1Q96BY2 351 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 NECTIN4Q96NY8 510 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 WDFY2Q96P53 400 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 GAD1Q99259 594 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARPC5LQ9BPX5 153 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 MED20Q9H944 212 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 GNB4Q9HAV0 340 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 GGA3Q9NZ52 723 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR6C2Q9NZP2 312 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF510Q9Y2H8 683 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANKRD61A6NGH8 418 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 A8MXK9 166 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 NDUFS4O43181 175 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 GH2P01242 217 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 FOLR2P14207 255 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM11P17152 192 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 KLK2P20151 261 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 IL4RP24394 825 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACADLP28330 430 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 NMBRP28336 390 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 DRD3P35462 400 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 CAPGP40121 348 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 TSFMP43897 325 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 SQLEQ14534 574 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 EIPR1Q53HC9 387 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 MDH1BQ5I0G3 518 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 C20orf194Q5TEA3 1177 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM198Q66K66 360 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 CYP26C1Q6V0L0 522 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM114A1Q8IWE2 563 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDK20Q8IZL9 346 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 METTL4Q8N3J2 472 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 FRMD1Q8N878 549 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANKRD42Q8N9B4 389 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 TBC1D16Q8TBP0 767 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF577Q9BSK1 485 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 NUP85Q9BW27 656 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 S1PR5Q9H228 398 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 DNAJC18Q9H819 358 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 NDE1Q9NXR1 346 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 CACNG4Q9UBN1 327 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 B4GALT7Q9UBV7 327 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa2.2□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms