RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 APCDD1Q8J025 514 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 DCAF4L2Q8NA75 395 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 ATG4AQ8WYN0 398 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 SHC3Q92529 594 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 NT5C3BQ969T7 300 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 ALG14Q96F25 216 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 PPP1R16AQ96I34 528 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 TBCBQ99426 244 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 FEM1AQ9BSK4 669 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 RETREG1Q9H6L5 497 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 DDIT4Q9NX09 232 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 VPS28Q9UK41 221 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 OR51B4Q9Y5P0 310 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 FAM149AA5PLN7 773 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 PLK4O00444 970 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 KPNA5O15131 536 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 RTN2O75298 545 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 NXPH3O95157 252 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 ALPPL2P10696 532 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 ACVR2AP27037 513 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 CXCR5P32302 372 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 ACTN2P35609 894 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 GRIA3P42263 894 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 HMGA2P52926 109 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 MAPK10P53779 464 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 PRKAG1P54619 331 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 CNTN1Q12860 1018 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 BMPR2Q13873 1038 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 ARHGEF7Q14155 803 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 BECN1Q14457 450 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 SLC29A2Q14542 456 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 DLG2Q15700 870 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 GBP6Q6ZN66 633 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 ARCQ7LC44 396 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 GATAD2AQ86YP4 633 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 EID2Q8N6I1 236 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 OR4C6Q8NH72 309 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 RFKQ969G6 155 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 GRAMD1AQ96CP6 724 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 CPXM1Q96SM3 734 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 AGAP2Q99490 1192 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 PRORYQ9H606 182 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 RWDD2AQ9UIY3 292 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 SARDHQ9UL12 918 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 STAP1Q9ULZ2 295 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 SH2B3Q9UQQ2 575 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 POM121BA6NF01 834 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 NEMP2A6NFY4 417 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 BECN2A8MW95 431 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 LSM8O95777 96 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 ONECUT2O95948 504 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 F9P00740 461 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 PDHA1P08559 390 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 THEGLP0DJG4 465 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 CKMT1AP12532 417 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 SRCP12931 536 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF18P17022 549 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 IL1R2P27930 398 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 AKT2P31751 481 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 CXCR3P49682 368 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 UCNP55089 124 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 TAS2R38P59533 333 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 COL10A1Q03692 680 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 SLC20A2Q08357 652 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 DNAJC3Q13217 504 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 TAF5Q15542 800 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 EXOC3L4Q17RC7 722 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 TBC1D25Q3MII6 688 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 KLHL10Q6JEL2 608 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 RNF44Q7L0R7 432 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 MAVSQ7Z434 540 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 HORMAD1Q86X24 394 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 ERICH1Q86X53 443 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF683Q8IZ20 524 aa6.84□□□□□ -1.31
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