RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 NFATC1O95644 943 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 BCL10O95999 233 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 PLAUP00749 431 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 KRT6BP04259 564 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 PLA2G4BP0C869 781 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 FPR3P25089 353 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 CTNNB1P35222 781 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 KRT6CP48668 564 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 HTR6P50406 440 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF132P52740 706 aa2.2□□□□□ -2.06
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PDE4D-218ENST00000509368 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 FNDC7Q5VTL7 733 aa2.2□□□□□ -2.06
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PDE4D-218ENST00000509368 PIGKQ92643 395 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 HAS1Q92839 578 aa2.2□□□□□ -2.06
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PDE4D-218ENST00000509368 Q96MF0 132 aa2.2□□□□□ -2.06
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PDE4D-218ENST00000509368 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
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PDE4D-218ENST00000509368 KRT23Q9C075 422 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 ATG10Q9H0Y0 220 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
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PDE4D-218ENST00000509368 COX16Q9P0S2 106 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SEPT10Q9P0V9 454 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 STK39Q9UEW8 545 aa2.2□□□□□ -2.06
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PDE4D-218ENST00000509368 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 FBXW2Q9UKT8 454 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 TCAF1Q9Y4C2 921 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 NSD3Q9BZ95 1437 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 A0A1B0GWJ7 208 aa2.19□□□□□ -2.06
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PDE4D-218ENST00000509368 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
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PDE4D-218ENST00000509368 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
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PDE4D-218ENST00000509368 CRAMP1Q96RY5 1269 aa2.19□□□□□ -2.06
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PDE4D-218ENST00000509368 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 FAM118AQ9NWS6 357 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 MCM9Q9NXL9 1143 aa2.19□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SMC3Q9UQE7 1217 aa2.19□□□□□ -2.06
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