RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-240	ENST00000495293	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ARHGAP25	P42331	645 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CCDC14	Q49A88	953 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ACCSL	Q4AC99	568 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF425	Q6IV72	752 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	C8orf74	Q6P047	294 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	FBXL22	Q6P050	247 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	EMB	Q6PCB8	327 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	WDR59	Q6PJI9	974 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	MON1B	Q7L1V2	547 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	FAM131B	Q86XD5	332 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	HMGB4	Q8WW32	186 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	NT5C3B	Q969T7	300 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	APIP	Q96GX9	242 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	MPP4	Q96JB8	637 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CCDC114	Q96M63	670 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	MCEE	Q96PE7	176 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CNPY3	Q9BT09	278 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PIGV	Q9NUD9	493 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	VPS28	Q9UK41	221 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PADI4	Q9UM07	663 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SNX12	Q9UMY4	172 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293		A0A087WV62	115 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293		E9PAM4	449 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293		F5H697	171 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	MYO1F	O00160	1098 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SLC16A6	O15403	523 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	FRS3	O43559	492 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PRPSAP2	O60256	369 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	DNAJB5	O75953	348 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	DNTT	P04053	509 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	HSD3B1	P14060	373 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	OXTR	P30559	389 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CD70	P32970	193 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CSK	P41240	450 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	DPP6	P42658	865 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SGSH	P51688	502 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF134	P52741	427 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	RAB1A	P62820	205 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ECT2L	Q008S8	904 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	LMAN2	Q12907	356 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PTP4A2	Q12974	167 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	MAMLD1	Q13495	774 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	TUBB3	Q13509	450 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF234	Q14588	700 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PTPRR	Q15256	657 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	RPS6KA1	Q15418	735 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SLC18A3	Q16572	532 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ODF2	Q5BJF6	829 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CFAP58	Q5T655	872 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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