RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490653.1

PRPF4B-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF4B, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 GUCA1BQ9UMX6 200 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 OR6C74A6NCV1 312 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 KCNJ13O60928 360 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 SPAG6O75602 509 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 RASSF9O75901 435 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
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PRPF4B-208ENST00000490653 PRKAR1AP10644 381 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 CD82P27701 267 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 NOS3P29474 1203 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 OAS2P29728 719 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 CDC25BP30305 580 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 ITGA9Q13797 1035 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 SEPT6Q14141 434 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 OASLQ15646 514 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 C16orf46Q6P387 395 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 CEACAM20Q6UY09 585 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 SNX20Q7Z614 316 aa7.13□□□□□ -1.27
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PRPF4B-208ENST00000490653 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 NLGN4XQ8N0W4 816 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 NXPE1Q8N323 547 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 CLDN19Q8N6F1 224 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 OR4E2Q8NGC2 313 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 OR2L2Q8NH16 312 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF778Q96MU6 729 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 XKR8Q9H6D3 395 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 POT1Q9NUX5 634 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 SMOXQ9NWM0 555 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 IMPACTQ9P2X3 320 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 CRLS1Q9UJA2 301 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 CCDC162PA2VCL2 907 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 TGFBR3LH3BV60 316 aa7.12□□□□□ -1.27
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PRPF4B-208ENST00000490653 LIASO43766 372 aa7.12□□□□□ -1.27
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PRPF4B-208ENST00000490653 KCNJ1P48048 391 aa7.12□□□□□ -1.27
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PRPF4B-208ENST00000490653 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 TERF1P54274 439 aa7.12□□□□□ -1.27
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PRPF4B-208ENST00000490653 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa7.12□□□□□ -1.27
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PRPF4B-208ENST00000490653 MEGF10Q96KG7 1140 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 FERD3LQ96RJ6 166 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 UCN2Q96RP3 112 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 KLHL25Q9H0H3 589 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 OR52A5Q9H2C5 316 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF4B-208ENST00000490653 HRASLS2Q9NWW9 162 aa7.12□□□□□ -1.27
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