RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 SMSP52788 366 aa6.78□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 CDH8P55286 799 aa6.78□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 DSG2Q14126 1118 aa6.78□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 GRM3Q14832 879 aa6.78□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 VPS26BQ4G0F5 336 aa6.78□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 STEAP4Q687X5 459 aa6.78□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 CNSTQ6PJW8 725 aa6.78□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 CES3Q6UWW8 571 aa6.78□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 CLHC1Q8NHS4 586 aa6.78□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 RNF34Q969K3 372 aa6.78□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 ROPN1LQ96C74 230 aa6.78□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 DCAF5Q96JK2 942 aa6.78□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARNT2Q9HBZ2 717 aa6.78□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF112Q9UJU3 913 aa6.78□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa6.78□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.78□□□□□ -1.32
CACNA2D3-210ENST00000490478 F5H423 210 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 hCG_1984214I3L0E3 225 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 ECDO95905 644 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 TPOP07202 933 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 JUNDP17535 347 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 HLA-FP30511 346 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 MAGEA6P43360 314 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 GLRBP48167 497 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 FGFBP1Q14512 234 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 GBX1Q14549 363 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 PTPRCAPQ14761 206 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 ANKRD54Q6NXT1 300 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM180BQ6P0A1 224 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 C5orf46Q6UWT4 87 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZYG11AQ6WRX3 759 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 RBP7Q96R05 134 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM245Q9H330 911 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRDM9Q9NQV7 894 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 SETD4Q9NVD3 440 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 CTSFQ9UBX1 484 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 GABRQQ9UN88 632 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 EDARQ9UNE0 448 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 FKBP7Q9Y680 259 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 MEGF6O75095 1541 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 G3V2T6 193 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 K7ENM7 598 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 LGALS8O00214 317 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 NR5A2O00482 541 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC30A4O14863 429 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 FABP7O15540 132 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 CBX7O95931 251 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 FOSP01100 380 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 GNRH1P01148 92 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 HK1P19367 917 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 CAPN3P20807 821 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 HSD3B2P26439 372 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 GNALP38405 381 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 CTSKP43235 329 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 LIMK1P53667 647 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 AIF1P55008 147 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 SNAP25P60880 206 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 ASAH1Q13510 395 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 CYS1Q717R9 158 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 SV2AQ7L0J3 742 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 GDPD1Q8N9F7 314 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 CYP2W1Q8TAV3 490 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPR151Q8TDV0 419 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 VPS39Q96JC1 886 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 MRGPRX2Q96LB1 330 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 HYLS1Q96M11 299 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 ITPAQ9BY32 194 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPR63Q9BZJ6 419 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM8AQ9HCN3 771 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 CYP4F12Q9HCS2 524 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 ASAH2Q9NR71 780 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 ABCB8Q9NUT2 735 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 ERVK-19Q9WJR5 959 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 ANKRD12Q6UB98 2062 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 STX16O14662 325 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 PLA2G10O15496 165 aa6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CACNA2D3-210ENST00000490478 HPRP00739 348 aa6.77□□□□□ -1.33
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