RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485349.5

SKIV2L-211, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 734 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-211ENST00000485349 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa16.4■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 LRRC57Q8N9N7 239 aa16.4■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 CPT1CQ8TCG5 803 aa16.4■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa16.4■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa16.4■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 LACRTQ9GZZ8 138 aa16.4■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 MVB12BQ9H7P6 319 aa16.4■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 ACTR10Q9NZ32 417 aa16.4■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 ICKQ9UPZ9 632 aa16.4■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC78A2IDD5 438 aa16.39■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 GRID2IPA4D2P6 1211 aa16.39■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 C2orf74A8MZ97 194 aa16.39■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 CEACAM4O75871 244 aa16.39■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 GNLYP22749 145 aa16.39■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 CD151P48509 253 aa16.39■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 RPA4Q13156 261 aa16.39■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 NCF4Q15080 339 aa16.39■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa16.39■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa16.39■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 TRIM73Q86UV7 250 aa16.39■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 ZBTB2Q8N680 514 aa16.39■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 FAM71DQ8N9W8 422 aa16.39■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 FDCSPQ8NFU4 85 aa16.39■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 OR5AR1Q8NGP9 310 aa16.39■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 LRRC45Q96CN5 670 aa16.39■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 PANX2Q96RD6 677 aa16.39■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 SYTL2Q9HCH5 934 aa16.39■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 BTNL10A8MVZ5 291 aa16.38■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 E7EQ34 232 aa16.38■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF749O43361 778 aa16.38■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 VPS4BO75351 444 aa16.38■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 VAV2P52735 878 aa16.38■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 GDF10P55107 478 aa16.38■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 CACNG1Q06432 222 aa16.38■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 ATP1A4Q13733 1029 aa16.38■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 PARP6Q2NL67 630 aa16.38■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 SPESP1Q6UW49 350 aa16.38■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 RAD9BQ6WBX8 426 aa16.38■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 EFCAB3Q8N7B9 438 aa16.38■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 ACRBPQ8NEB7 543 aa16.38■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa16.38■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 NUDT9Q9BW91 350 aa16.38■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa16.38■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 LRRC40Q9H9A6 602 aa16.38■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa16.38■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 LUZP4Q9P127 313 aa16.38■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 SERTAD3Q9UJW9 196 aa16.38■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 VPS4AQ9UN37 437 aa16.38■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 PRSS21Q9Y6M0 314 aa16.38■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 UNC79Q9P2D8 2635 aa16.38■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 OR51F1A6NGY5 319 aa16.37■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 A6NL46 340 aa16.37■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF185O15231 689 aa16.37■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 MAP3K7O43318 606 aa16.37■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 HCRTR1O43613 425 aa16.37■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 UGT2B7P16662 529 aa16.37■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 CETN2P41208 172 aa16.37■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 ZIC1Q15915 447 aa16.37■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 DEFB110Q30KQ9 67 aa16.37■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF449Q6P9G9 518 aa16.37■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 NAPRTQ6XQN6 538 aa16.37■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 GALNT11Q8NCW6 608 aa16.37■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 STYXQ8WUJ0 223 aa16.37■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 FAM60AQ9NP50 221 aa16.37■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa16.37■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa16.37■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa16.37■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 ESPL1Q14674 2120 aa16.36■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 NUP210LQ5VU65 1888 aa16.36■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 C9J4A7 227 aa16.36■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 AP2A2O94973 939 aa16.36■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 AP2A1O95782 977 aa16.36■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 PTMAP06454 111 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 CTSBP07858 339 aa16.36■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 GSTM1P09488 218 aa16.36■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 MSNP26038 577 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 SHMT2P34897 504 aa16.36■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 GSTM4Q03013 218 aa16.36■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 RAPSNQ13702 412 aa16.36■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 BRD3Q15059 726 aa16.36■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC38Q502W7 563 aa16.36■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 UNC5AQ6ZN44 842 aa16.36■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 TMTC1Q8IUR5 882 aa16.36■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 Q8NA96 180 aa16.36■□□□□ 0.21
SKIV2L-211ENST00000485349 ELMO1Q92556 727 aa16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms