RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 TIGD2Q4W5G0 525 aa11.96□□□□□ -0.49
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PTPRF-212ENST00000477970 GALNT4Q8N4A0 578 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRF-212ENST00000477970 ASIC4Q96FT7 647 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRF-212ENST00000477970 EGFL8Q99944 293 aa11.96□□□□□ -0.49
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PTPRF-212ENST00000477970 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
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PTPRF-212ENST00000477970 SLC2A7Q6PXP3 512 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 AMIGO2Q86SJ2 522 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 EPHX4Q8IUS5 362 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 RIMKLAQ8IXN7 391 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 BPIFB1Q8TDL5 484 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
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