RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472091.1

ERVFRD-1-201, Transcript of endogenous retrovirus group FRD member 1, envelope, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ERVFRD-1, Length 3,198 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1-201ENST00000472091 GGT1P19440 569 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 SSTR4P31391 388 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 KRT20P35900 424 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 ARHGDIAP52565 204 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 FCGRTP55899 365 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 LILRA4P59901 499 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 PPP2R2BQ00005 443 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 TNFAIP1Q13829 316 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 PTPRNQ16849 979 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 TIGD6Q17RP2 521 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 PTCHD3Q3KNS1 767 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 PAMR1Q6UXH9 720 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 DLEU7Q6UYE1 221 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 Q6ZSR9 355 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 HORMAD1Q86X24 394 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 SCN4BQ8IWT1 228 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 TTC39CQ8N584 583 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 MINDY2Q8NBR6 621 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 GPR152Q8TDT2 470 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 PSMG2Q969U7 264 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 CPNE5Q9HCH3 593 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 MAT2BQ9NZL9 334 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 OGDHLQ9ULD0 1010 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 RNF6Q9Y252 685 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 A0A1W2PQ72 361 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 OR6C70A6NIJ9 312 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 H3BM21 787 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 KMOO15229 486 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 CREG1O75629 220 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 STSP08842 583 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 C7P10643 843 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 DDX5P17844 614 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 TNFRSF1BP20333 461 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 POU1F1P28069 291 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 CSRP3P50461 194 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 ATP4BP51164 291 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 ERVPABLB-1P60509 514 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 ABRAXAS2Q15018 415 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 LETMD1Q6P1Q0 360 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 RANBP10Q6VN20 620 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 CNTN4Q8IWV2 1026 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 CAMKK1Q8N5S9 505 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 STAG3L4Q8TBR4 150 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 TSSK3Q96PN8 268 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 OR52E6Q96RD3 313 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 EGFL8Q99944 293 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 CLSTN3Q9BQT9 956 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 DPY30Q9C005 99 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 SPATC1LQ9H0A9 340 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 ABCB9Q9NP78 766 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 CRTAC1Q9NQ79 661 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 NECTIN3Q9NQS3 549 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 KRT84Q9NSB2 600 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 TMEM39AQ9NV64 488 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 TMLHEQ9NVH6 421 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 MALT1Q9UDY8 824 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 SPEF1Q9Y4P9 236 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa7.09□□□□□ -1.27
ERVFRD-1-201ENST00000472091 UBR3Q6ZT12 1888 aa7.09□□□□□ -1.28
ERVFRD-1-201ENST00000472091 FAM234BA2RU67 622 aa7.08□□□□□ -1.28
ERVFRD-1-201ENST00000472091 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.08□□□□□ -1.28
ERVFRD-1-201ENST00000472091 E5RI56 91 aa7.08□□□□□ -1.28
ERVFRD-1-201ENST00000472091 MATN3O15232 486 aa7.08□□□□□ -1.28
ERVFRD-1-201ENST00000472091 PSMD3O43242 534 aa7.08□□□□□ -1.28
ERVFRD-1-201ENST00000472091 PEX14O75381 377 aa7.08□□□□□ -1.28
ERVFRD-1-201ENST00000472091 TULP3O75386 442 aa7.08□□□□□ -1.28
ERVFRD-1-201ENST00000472091 MATN4O95460 622 aa7.08□□□□□ -1.28
ERVFRD-1-201ENST00000472091 CBLP22681 906 aa7.08□□□□□ -1.28
ERVFRD-1-201ENST00000472091 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
ERVFRD-1-201ENST00000472091 DAPP51397 102 aa7.08□□□□□ -1.28
ERVFRD-1-201ENST00000472091 ERVK-8P63133 956 aa7.08□□□□□ -1.28
ERVFRD-1-201ENST00000472091 GPLD1P80108 840 aa7.08□□□□□ -1.28
ERVFRD-1-201ENST00000472091 ZXDBP98169 803 aa7.08□□□□□ -1.28
ERVFRD-1-201ENST00000472091 IHHQ14623 411 aa7.08□□□□□ -1.28
ERVFRD-1-201ENST00000472091 KCTD2Q14681 263 aa7.08□□□□□ -1.28
ERVFRD-1-201ENST00000472091 GPR162Q16538 588 aa7.08□□□□□ -1.28
ERVFRD-1-201ENST00000472091 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
ERVFRD-1-201ENST00000472091 SIRPB2Q5JXA9 342 aa7.08□□□□□ -1.28
ERVFRD-1-201ENST00000472091 MARC1Q5VT66 337 aa7.08□□□□□ -1.28
ERVFRD-1-201ENST00000472091 AGAP6Q5VW22 663 aa7.08□□□□□ -1.28
ERVFRD-1-201ENST00000472091 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
ERVFRD-1-201ENST00000472091 MAMSTRQ6ZN01 415 aa7.08□□□□□ -1.28
ERVFRD-1-201ENST00000472091 MIB1Q86YT6 1006 aa7.08□□□□□ -1.28
ERVFRD-1-201ENST00000472091 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa7.08□□□□□ -1.28
ERVFRD-1-201ENST00000472091 CRYBG2Q8N1P7 616 aa7.08□□□□□ -1.28
ERVFRD-1-201ENST00000472091 STX19Q8N4C7 294 aa7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.8 ms