RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 LRRC17Q8N6Y2 441 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 UBR7Q8N806 425 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 YIPF7Q8N8F6 280 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 OR6B3Q8NGW1 331 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 POC1BQ8TC44 478 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 SPPL3Q8TCT6 385 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 CAMK1GQ96NX5 476 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 PINK1Q9BXM7 581 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 ERVK-6Q9BXR3 956 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 KLHL31Q9H511 634 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 SPACA1Q9HBV2 294 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 DUSP22Q9NRW4 184 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 SH3BP4Q9P0V3 963 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 ERVK-18Q9QC07 812 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 MGAT4AQ9UM21 535 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 KCNJ14Q9UNX9 436 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 COG5Q9UP83 839 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 USP22Q9UPT9 525 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 KCNH4Q9UQ05 1017 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 ALG6Q9Y672 507 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 TAF1P21675 1872 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 SCN9AQ15858 1988 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A1B0GV90 55 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 H7C0S8 307 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 AP3D1O14617 1153 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 GPR171O14626 319 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 FSCN2O14926 492 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 TO15178 435 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 TCAPO15273 167 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 TP73O15350 636 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 AKR7A2O43488 359 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 PEX10O60683 326 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 SNNO75324 88 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 ULK1O75385 1050 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 SNAPC5O75971 98 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 TPOP07202 933 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 CSF1RP07333 972 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 ADRB1P08588 477 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 NFKB1P19838 968 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 HTR1BP28222 390 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 GDI1P31150 447 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 DPP6P42658 865 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 KCNJ1P48048 391 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 PSPHP78330 225 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 BMPR2Q13873 1038 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 PLCL1Q15111 1095 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 LLGL1Q15334 1064 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 COLEC12Q5KU26 742 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 TPRG1LQ5T0D9 272 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 MARCH8Q5T0T0 291 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 NXNL2Q5VZ03 156 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 USP53Q70EK8 1073 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 PGAP1Q75T13 922 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 P2RY8Q86VZ1 359 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 MICU3Q86XE3 530 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 PARP16Q8N5Y8 322 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF781Q8N8C0 355 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 CAMKVQ8NCB2 501 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 DTD1Q8TEA8 209 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 ALG3Q92685 438 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 NTAN1Q96AB6 310 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 FRMD6Q96NE9 622 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC90BQ9GZT6 254 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 METTL9Q9H1A3 318 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 PRO3102Q9H379 93 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 LUZP4Q9P127 313 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 CPA4Q9UI42 421 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 OSGIN1Q9UJX0 560 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 MYH3P11055 1940 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-208ENST00000471759 NFASCO94856 1347 aa6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms