RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 TSPAN12O95859 305 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 RPN2P04844 631 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 GP1BAP07359 652 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 FTH1P19P0C7X4 201 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 MPC1LP0DKB6 136 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 PNLIPP16233 465 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 TYRP1P17643 537 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 CNTFP26441 200 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 NDUFS1P28331 727 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 GMPRP36959 345 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 GPR3P46089 330 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 BDKRB1P46663 353 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 SERPINB8P50452 374 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 CCL7P80098 99 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 IFFO1Q0D2I5 559 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 ADGRD1Q6QNK2 874 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 DHRS13Q6UX07 377 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 UNC5DQ6UXZ4 953 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 CYHR1Q6ZMK1 362 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 NEK10Q6ZWH5 1172 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 SPATA6LQ8N4H0 392 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 MREGQ8N565 214 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 OR52E1Q8NGJ3 308 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 ANKRD49Q8WVL7 239 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 LCN9Q8WX39 176 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 ZMYND15Q9H091 742 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 XKR8Q9H6D3 395 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 MVB12BQ9H7P6 319 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 UCK1Q9HA47 277 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 POPDC3Q9HBV1 291 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 SYTL2Q9HCH5 934 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 SNX15Q9NRS6 342 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 FETUBQ9UGM5 382 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 TBK1Q9UHD2 729 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 SLC24A2Q9UI40 661 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 PLAGL1Q9UM63 463 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 PLAAQ9Y263 795 aa8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 A0A1W2PQM1 296 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 TLDC2A0PJX2 215 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC151A5D8V7 595 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 LILRA5A6NI73 299 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 ARHGEF33A8MVX0 844 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 BTN3A1O00481 513 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 ZW10O43264 779 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 OPA1O60313 960 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 KRT37O76014 449 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 UBXN7O94888 489 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 C1orf105O95561 183 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 SYF2O95926 243 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 CATP04040 527 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 PROS1P07225 676 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 NUDT17P0C025 328 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 SLC35E2BP0CK96 405 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC166P0CW27 439 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 TPBGLP0DKB5 382 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 AMD1P17707 334 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 CD1CP29017 333 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 CRABP2P29373 138 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 TYK2P29597 1187 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 CCNFP41002 786 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 ID4P47928 161 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 CLDN6P56747 220 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 IRF9Q00978 393 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 ILKQ13418 452 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 NR1D2Q14995 579 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 CCSMST1Q4G0I0 132 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 PPM1JQ5JR12 505 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 LGSNQ5TDP6 509 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 TTC23LQ6PF05 361 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 USP53Q70EK8 1073 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 TBC1D21Q8IYX1 336 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 OR4E2Q8NGC2 313 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 OR10G6Q8NH81 332 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 ZFPM2Q8WW38 1151 aa8.59□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 ASB11Q8WXH4 323 aa8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms