RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF470Q6ECI4 717 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 SYT10Q6XYQ8 523 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 OTOAQ7RTW8 1153 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 AMIGO1Q86WK6 493 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 ZFAND4Q86XD8 727 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 PDIK1LQ8N165 341 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 OR5AR1Q8NGP9 310 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 OR5K2Q8NHB8 316 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 LPGAT1Q92604 370 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 SNF8Q96H20 258 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 KRT12Q99456 494 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 MAP3K3Q99759 626 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 TRIM51Q9BSJ1 452 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 SEMA5BQ9P283 1151 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 NBEAQ8NFP9 2946 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 ANKRD12Q6UB98 2062 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 GSAPA4D1B5 854 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 EFCAB8A8MWE9 144 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 E5RI56 91 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 GPC4O75487 556 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 FMO4P31512 558 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 SHMT2P34897 504 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 CXADRP78310 365 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 IL11RAQ14626 422 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 BBS9Q3SYG4 887 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 CTSL3PQ5NE16 218 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 UNC5DQ6UXZ4 953 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 PMEPA1Q969W9 287 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 OR6C1Q96RD1 312 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 CTRCQ99895 268 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM167BQ9BTA0 163 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC68Q9H2F9 335 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 POMT2Q9UKY4 750 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 CRYL1Q9Y2S2 319 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 MRFAP1Q9Y605 127 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM169AQ9Y6X4 670 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 ITPR1Q14643 2758 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 C2orf74A8MZ97 194 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 MAP3K7O43318 606 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 SLCO2B1O94956 709 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 PKMP14618 531 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 CDH3P22223 829 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 ITGA8P53708 1063 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 ARL4CP56559 192 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 HSD11B2P80365 405 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 CRYMQ14894 314 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 TGIF1Q15583 401 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 SPANXN3Q5MJ09 141 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 MANEAQ5SRI9 462 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 TMTC4Q5T4D3 741 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 TTC23LQ6PF05 361 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC81Q6ZN84 652 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 CENPUQ71F23 418 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 MAATS1Q7Z4T9 603 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 KCNMB4Q86W47 210 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 DTX1Q86Y01 620 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 VRK3Q8IV63 474 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 BBOF1Q8ND07 529 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 SPATA4Q8NEY3 305 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 LRRC39Q96DD0 335 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 CRELD1Q96HD1 420 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC41A2Q96JW4 573 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 FOPNLQ96NB1 174 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 BIRC8Q96P09 236 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 TRIM31Q9BZY9 425 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 PRORYQ9H606 182 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 APMAPQ9HDC9 416 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 PDE7BQ9NP56 450 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 C1GALT1Q9NS00 363 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 CDYLQ9Y232 598 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 SSUH2Q9Y2M2 353 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 LAMA5O15230 3695 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 PIPSLA2A3N6 862 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM187AA6NFU0 413 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 BTN3A3O00478 584 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 BTN3A1O00481 513 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 NIPSNAP2O75323 286 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 S1PR4O95977 384 aa14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms