RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454741.5

TTC28-AS1-219, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,064 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-219ENST00000454741 BLKP51451 505 aa15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PCDH1Q08174 1060 aa15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CARD16Q5EG05 197 aa15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CCDC80Q76M96 950 aa15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 EURLQ9NYK6 297 aa15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 A0A0X1KG70 313 aa15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 RGS20O76081 388 aa15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 HMGN1P05114 100 aa15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PCCBP05166 539 aa15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 BTN2A1Q7KYR7 527 aa15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CYP2U1Q7Z449 544 aa15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CADM2Q8N3J6 435 aa15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 LINC00471Q8N535 108 aa15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 OXR1Q8N573 874 aa15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CLCC1Q96S66 551 aa15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 GPER1Q99527 375 aa15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CNPPD1Q9BV87 410 aa15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TFECO14948 347 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CD2P06729 351 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MTTPP55157 894 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 WDR4P57081 412 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TIGD5Q53EQ6 642 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ADGRF1Q5T601 910 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 KREMEN2Q8NCW0 462 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 HERVK_113Q902F9 699 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PRRG4Q9BZD6 226 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CCL22O00626 93 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 C8AP07357 584 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 FOXN2P32314 431 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PPP2R2BQ00005 443 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ECT2LQ008S8 904 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SUSD3Q96L08 255 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PHF12Q96QT6 1004 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 UPB1Q9UBR1 384 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 IQCF5A8MTL0 148 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MATN2O00339 956 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CBSLP0DN79 551 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CBSP35520 551 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 GRK6P43250 576 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 DAG1Q14118 895 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ADNP2Q6IQ32 1131 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TAF8Q7Z7C8 310 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 AMZ2Q86W34 360 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 IFNL1Q8IU54 200 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 RIPOR3Q96MK2 946 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TESMINQ9Y4I5 508 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 B3GALT2O43825 422 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 RASGRP1O95267 797 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PRAMEF12O95522 483 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SERPINA3P01011 423 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 S100A1P23297 94 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 AKT2P31751 481 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 RNF220Q5VTB9 566 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 COPS4Q9BT78 406 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MOCS1Q9NZB8 636 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PDCD5O14737 125 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 USP30Q70CQ3 517 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ZMIZ2Q8NF64 920 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 UFD1Q92890 307 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 HPS1Q92902 700 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 LMLNQ96KR4 655 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 COMMD4Q9H0A8 199 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TMED5Q9Y3A6 229 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PHLPP1O60346 1717 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ZNF487B1APH4 448 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 NFKBIEO00221 500 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MVKQ03426 396 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 HSF2Q03933 536 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 NUDT13Q86X67 352 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MCEMP1Q8IX19 187 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 OR52J3Q8NH60 311 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SUV39H2Q9H5I1 410 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 COQ10BQ9H8M1 238 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ZNF879B4DU55 563 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 C8BP07358 591 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 HSPB3Q12988 150 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 E2F2Q14209 437 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 FRRS1Q6ZNA5 592 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PARP8Q8N3A8 854 aa14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms