RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448992.5

RHBDD1-209, Transcript of rhomboid domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene RHBDD1, Length 576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1-209ENST00000448992 IP6K3Q96PC2 410 aa14.64□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa14.64□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 MFRPQ9BY79 579 aa14.64□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 KLHL25Q9H0H3 589 aa14.64□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 OR52A5Q9H2C5 316 aa14.64□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 ACTR10Q9NZ32 417 aa14.64□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 QSOX1O00391 747 aa14.63□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 CCL22O00626 93 aa14.63□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 ZNF749O43361 778 aa14.63□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 KDM1AO60341 852 aa14.63□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 KLHL41O60662 606 aa14.63□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 CD63P08962 238 aa14.63□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 OTX2P32243 289 aa14.63□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 SHMT2P34897 504 aa14.63□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 RWDD2BP57060 319 aa14.63□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 PRKG2Q13237 762 aa14.63□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 ATP1A4Q13733 1029 aa14.63□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 SPARCL1Q14515 664 aa14.63□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 KYNUQ16719 465 aa14.63□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 ZNF789Q5FWF6 425 aa14.63□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa14.63□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 SERPINA9Q86WD7 417 aa14.63□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 GLIS1Q8NBF1 620 aa14.63□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 PHC3Q8NDX5 983 aa14.63□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 PNPLA2Q96AD5 504 aa14.63□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 TCTN2Q96GX1 697 aa14.63□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 NUDT9Q9BW91 350 aa14.63□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 XKR8Q9H6D3 395 aa14.63□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 ARNT2Q9HBZ2 717 aa14.63□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 IRAK4Q9NWZ3 460 aa14.63□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 LUZP4Q9P127 313 aa14.63□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa14.63□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa14.63□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 PEX12O00623 359 aa14.62□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 OR2B3O76000 313 aa14.62□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 AP2A2O94973 939 aa14.62□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 IGHEP01854 428 aa14.62□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 ALPPP05187 535 aa14.62□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 PVRP15151 417 aa14.62□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 PDHA2P29803 388 aa14.62□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 PTPN7P35236 360 aa14.62□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 FOLR3P41439 243 aa14.62□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 CACNG1Q06432 222 aa14.62□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 SYTL3Q4VX76 610 aa14.62□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 FAM69BQ5VUD6 431 aa14.62□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 MLIPQ5VWP3 458 aa14.62□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 SPESP1Q6UW49 350 aa14.62□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa14.62□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 TMTC1Q8IUR5 882 aa14.62□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 ZBTB2Q8N680 514 aa14.62□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 CLEC1AQ8NC01 280 aa14.62□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa14.62□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 FAM118BQ9BPY3 351 aa14.62□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 NDOR1Q9UHB4 597 aa14.62□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 TFR2Q9UP52 801 aa14.62□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 ASF1AQ9Y294 204 aa14.62□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 LRRK2Q5S007 2527 aa14.62□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 NBASA2RRP1 2371 aa14.62□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa14.61□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa14.61□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 F8W8V4 182 aa14.61□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 H7C0S8 307 aa14.61□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 LDB2O43679 373 aa14.61□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 FTH1P02794 183 aa14.61□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 CAPN1P07384 714 aa14.61□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 NSG1P42857 185 aa14.61□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 RAPSNQ13702 412 aa14.61□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 P3H1Q32P28 736 aa14.61□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa14.61□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 SLC6A19Q695T7 634 aa14.61□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 DENND5AQ6IQ26 1287 aa14.61□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa14.61□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 CLDN19Q8N6F1 224 aa14.61□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 TC2NQ8N9U0 490 aa14.61□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 PROKR1Q8TCW9 393 aa14.61□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 ELMO1Q92556 727 aa14.61□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 TRIM5Q9C035 493 aa14.61□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 LRRC40Q9H9A6 602 aa14.61□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 CASS4Q9NQ75 786 aa14.61□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 TXLNGQ9NUQ3 528 aa14.61□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa14.61□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 C5AR2Q9P296 337 aa14.61□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 POLG2Q9UHN1 485 aa14.61□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 SRPK3Q9UPE1 567 aa14.61□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa14.6□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 TCP11X1B4DZS4 312 aa14.6□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 GAS8O95995 478 aa14.6□□□□□ -0.07
RHBDD1-209ENST00000448992 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms