RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441099.5

TRAPPC12-209, Transcript of trafficking protein particle complex 12, humanhuman

TSL 3

Gene TRAPPC12, Length 698 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12-209ENST00000441099 SLC41A2Q96JW4 573 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 CD180Q99467 661 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 MAP3K3Q99759 626 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 SRMSQ9H3Y6 488 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 XKR8Q9H6D3 395 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 APMAPQ9HDC9 416 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 SNX24Q9Y343 169 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 ACACAQ13085 2346 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 TLCD2A6NGC4 264 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 BTN3A3O00478 584 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 KPNA5O15131 536 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 KLK10O43240 276 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 RAD51CO43502 376 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 NIPSNAP2O75323 286 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 PKMP14618 531 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 SLC1A2P43004 574 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 RPL21P46778 160 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 SH3BP2P78314 561 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 C2orf54Q08AI8 447 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 ABRQ12979 859 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 GBX1Q14549 363 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 TMED2Q15363 201 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 TGIF1Q15583 401 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 ARMC6Q6NXE6 501 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 ZNF549Q6P9A3 640 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 MAATS1Q7Z4T9 603 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 AMIGO1Q86WK6 493 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 CALML6Q8TD86 181 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 CRELD1Q96HD1 420 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 PPM1MQ96MI6 270 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 CTRCQ99895 268 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 ERP44Q9BS26 406 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 NAT9Q9BTE0 207 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 SPRY4Q9C004 299 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 TWSG1Q9GZX9 223 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 LATS2Q9NRM7 1088 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 GALPQ9UBC7 116 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 POLG2Q9UHN1 485 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 POMT2Q9UKY4 750 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 ICKQ9UPZ9 632 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 TEX264Q9Y6I9 313 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 MYLKQ15746 1914 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 URB1O60287 2271 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 BTN3A1O00481 513 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 ERVK-10P10266 1014 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 LIPCP11150 499 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 ELK3P41970 407 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 CBLBQ13191 982 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 HIF1AQ16665 826 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 SPANXN3Q5MJ09 141 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 OTOAQ7RTW8 1153 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 KCNMB4Q86W47 210 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 CARFQ8N187 725 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 FAM136AQ96C01 138 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 LRRC39Q96DD0 335 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 ZPBPQ9BS86 351 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 FAM167BQ9BTA0 163 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 CDC23Q9UJX2 597 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 FBXO5Q9UKT4 447 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 MED16Q9Y2X0 877 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC12-209ENST00000441099 CACNA1BQ00975 2339 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 MATN2O00339 956 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 HAUS5O94927 633 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 FOLR1P15328 257 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 ARL4CP56559 192 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 MPP1Q00013 466 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 PRKAA1Q13131 559 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 GRB7Q14451 532 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 STEAP4Q687X5 459 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 DUPD1Q68J44 220 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 UNC5DQ6UXZ4 953 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 CEACAM20Q6UY09 585 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 UNC5AQ6ZN44 842 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 KMT5CQ86Y97 462 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 CFAP61Q8NHU2 1237 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 MENTQ9BUN1 341 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 PRORYQ9H606 182 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 PLAGL1Q9UM63 463 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 LHX6Q9UPM6 363 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 ITPR1Q14643 2758 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 UNC13CQ8NB66 2214 aa15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC12-209ENST00000441099 E7ESA3 106 aa15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms