RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 ETV3P41162 512 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 HPCAP84074 193 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 HHEXQ03014 270 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 GALNT2Q10471 571 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 TRAF2Q12933 501 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
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PTPRR-204ENST00000440835 Q6ZVL8 140 aa5.91□□□□□ -1.46
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PTPRR-204ENST00000440835 MAP7D3Q8IWC1 876 aa5.91□□□□□ -1.46
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PTPRR-204ENST00000440835 CSPG4P5Q96PW8 444 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 CD180Q99467 661 aa5.91□□□□□ -1.46
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PTPRR-204ENST00000440835 HAO1Q9UJM8 370 aa5.91□□□□□ -1.46
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PTPRR-204ENST00000440835 RFPL1O75677 317 aa5.9□□□□□ -1.47
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PTPRR-204ENST00000440835 WT1P19544 449 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 GARSP41250 739 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
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PTPRR-204ENST00000440835 SPINT3P49223 89 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 PTSQ03393 145 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 WASHC2DQ5SRD0 308 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
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