RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440184.1

CBX1P1-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P1, Length 427 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P1-201ENST00000440184 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 RPS21P63220 83 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 CCL7P80098 99 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 GNA12Q03113 381 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 CCDC15Q0P6D6 951 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 KLF10Q13118 480 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 RAPGEF1Q13905 1077 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 BECN1Q14457 450 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 CLCA4Q14CN2 919 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 IRF4Q15306 451 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 IGFBP7Q16270 282 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 CAMK4Q16566 473 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 LINC00303Q3SY05 128 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 CARD16Q5EG05 197 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 FAXCQ5TGI0 409 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 FAM72AQ5TYM5 149 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 MANEALQ5VSG8 457 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 DENND2CQ68D51 928 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 FAM72DQ6L9T8 149 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 RETSATQ6NUM9 610 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 ZNF783Q6ZMS7 281 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 ZNF627Q7L945 461 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 NLRP14Q86W24 1093 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 FAM72BQ86X60 149 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 DNAAF5Q86Y56 855 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 PYROXD2Q8N2H3 581 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 PELI3Q8N2H9 469 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 SLC16A11Q8NCK7 471 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 TMEM35BQ8NCS4 154 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 DENND6BQ8NEG7 585 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 CCL4L1Q8NHW4 92 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 SLC20A1Q8WUM9 679 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 PATE1Q8WXA2 126 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 HTR3CQ8WXA8 447 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 C18orf8Q96DM3 657 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 PDXPQ96GD0 296 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 C1orf74Q96LT6 269 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 KLHL32Q96NJ5 620 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 TAAR9Q96RI9 348 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 HAPLN3Q96S86 360 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 IL12RB2Q99665 862 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 HEPHQ9BQS7 1158 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 TLR10Q9BXR5 811 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 SLC17A9Q9BYT1 436 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 PDCL3Q9H2J4 239 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 NDST4Q9H3R1 872 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 RDH14Q9HBH5 336 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 USP29Q9HBJ7 922 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 KLHL42Q9P2K6 505 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 POLHQ9Y253 713 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 ICE1Q9Y2F5 2266 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 SPTBP11277 2137 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 A0A1W2PQM1 296 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 NEMP2A6NFY4 417 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 C16orf96A6NNT2 1141 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 F8VZ95 297 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 K7ENP7 123 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 FPGTO14772 594 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 YY2O15391 372 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 TSPAN6O43657 245 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 TMCC1O94876 653 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 AGFG2O95081 481 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 LSM8O95777 96 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 GSRP00390 522 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 FSHBP01225 129 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 SLPIP03973 132 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 PRKAR1AP10644 381 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 UCHL3P15374 230 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 KRT4P19013 534 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 MAKP20794 623 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 UGT1A5P35504 534 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 THOP1P52888 689 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 MAZP56270 477 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 SNX16P57768 344 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 ERVPABLB-1P60509 514 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 HSD11B2P80365 405 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 SLC20A2Q08357 652 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 ABHD18Q0P651 414 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 GTF2H3Q13889 308 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 ALG11Q2TAA5 492 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P1-201ENST00000440184 KLHL40Q2TBA0 621 aa4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.5 ms