RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438929.5

BDNF-210, Transcript of brain derived neurotrophic factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene BDNF, Length 4,059 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDNF-210ENST00000438929 ZSWIM7Q19AV6 140 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 CCDC58Q4VC31 144 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 UNC50Q53HI1 259 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 TSTD2Q5T7W7 516 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 AGAP6Q5VW22 663 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 OVOS1Q6IE37 1185 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 TTC23LQ6PF05 361 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 TMEM174Q8WUU8 243 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 SIPA1Q96FS4 1042 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 EXOC2Q96KP1 924 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 AGAP4Q96P64 663 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 KCNC2Q96PR1 638 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 VPS35Q96QK1 796 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 PANX1Q96RD7 426 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 FERD3LQ96RJ6 166 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 TMEM209Q96SK2 561 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 SEMA3CQ99985 751 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 IER2Q9BTL4 223 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 BPIFA1Q9NP55 256 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 MAT2BQ9NZL9 334 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 MKLN1Q9UL63 735 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 SNX7Q9UNH6 387 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 CEP350Q5VT06 3117 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 IRS2Q9Y4H2 1338 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 MYL12BO14950 172 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 ERN1O75460 977 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 SCELO95171 688 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 SERPINF2P08697 491 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 GABRB3P28472 473 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 PIGAP37287 484 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 SLC9A3P48764 834 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 MLLT10P55197 1068 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 DSC2Q02487 901 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 STARD3Q14849 445 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 PTGR1Q14914 329 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 DEFB115Q30KQ5 88 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 SPRED1Q7Z699 444 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 GPR65Q8IYL9 337 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 METTL4Q8N3J2 472 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 CHST13Q8NET6 341 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 OR4L1Q8NH43 312 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 PPP3R2Q96LZ3 170 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 DUSP16Q9BY84 665 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 GPR63Q9BZJ6 419 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 PDZD7Q9H5P4 517 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 MYOZ2Q9NPC6 264 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 KCTD3Q9Y597 815 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 CREBBPQ92793 2442 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 ZNF831Q5JPB2 1677 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 FABP12A6NFH5 140 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 TLR5O60602 858 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 B3GAT3O94766 335 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 GOT2P00505 430 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 PRLP01236 227 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 ALPLP05186 524 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 ITGB1P05556 798 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 TGFB3P10600 412 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 GADD45AP24522 165 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 HTR1EP28566 365 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 AGTR2P50052 363 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 MVKQ03426 396 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 CES5AQ6NT32 575 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 PHC2Q8IXK0 858 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 NPWQ8N729 165 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 DNERQ8NFT8 737 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 SLC22A17Q8WUG5 538 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 SELENOMQ8WWX9 145 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 SLC38A4Q969I6 547 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 ACAT2Q9BWD1 397 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 TNKS2Q9H2K2 1166 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 CRISPLD1Q9H336 500 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 SH3BP4Q9P0V3 963 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 OPTCQ9UBM4 332 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 MAFFQ9ULX9 164 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 CFL2Q9Y281 166 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 BDP1A6H8Y1 2624 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 AGAP5A6NIR3 686 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 CDC7O00311 574 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 HAT1O14929 419 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 FABP3P05413 133 aa6.05□□□□□ -1.44
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