RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436066.3

PLEKHF1-201, Transcript of pleckstrin homology and FYVE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLEKHF1, Length 2,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF1-201ENST00000436066 HIST1H2AJQ99878 128 aa24.72■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 H2AFJQ9BTM1 129 aa24.72■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 MUC13Q9H3R2 512 aa24.72■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 ACTR8Q9H981 624 aa24.72■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 MARK1Q9P0L2 795 aa24.72■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 C7orf72A4D263 438 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 GRXCR2A6NFK2 248 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 AP1G1O43747 822 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 NUAK1O60285 661 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 CTSLP07711 333 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 NCK1P16333 377 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 EPORP19235 508 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 IL10P22301 178 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 HOXA9P31269 272 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 ETV3P41162 512 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 GNPDA1P46926 289 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 TMEM240Q5SV17 173 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 RGL4Q8IZJ4 473 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 ASB11Q8WXH4 323 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 OTUB2Q96DC9 234 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC29A1Q99808 456 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 PIF1Q9H611 641 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZFP14Q9HCL3 533 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 SMOXQ9NWM0 555 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 SOBPA7XYQ1 873 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 H0YJX3 145 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 ARNTLO00327 626 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 INPP4BO15327 924 aa24.71■■□□□ 1.55
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PLEKHF1-201ENST00000436066 SEC22BO75396 215 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 CEBPBP17676 345 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 VARSP26640 1264 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 OXTRP30559 389 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 GGT5P36269 586 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 GK3PQ14409 553 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 DLEU7Q6UYE1 221 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 GOLM1Q8NBJ4 401 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF597Q96LX8 424 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 PPM1MQ96MI6 270 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC2A11Q9BYW1 496 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 USP22Q9UPT9 525 aa24.71■■□□□ 1.55
PLEKHF1-201ENST00000436066 UPK3BL1B0FP48 263 aa24.7■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 UPK3BL2E5RIL1 263 aa24.7■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 BMP2P12643 396 aa24.7■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 TIMP2P16035 220 aa24.7■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 CYP51A1Q16850 503 aa24.7■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 POM121L1PQ3SYA9 428 aa24.7■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa24.7■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 ISLR2Q6UXK2 745 aa24.7■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 ANKFN1Q8N957 763 aa24.7■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 USP7Q93009 1102 aa24.7■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 LRTM1Q9HBL6 345 aa24.7■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 IL36AQ9UHA7 158 aa24.7■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC8A2Q9UPR5 921 aa24.7■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 CFAP99D6REC4 459 aa24.7■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 MPC1LP0DKB6 136 aa24.7■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 CKMT2P17540 419 aa24.7■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 PLIN5Q00G26 463 aa24.7■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 SMU1Q2TAY7 513 aa24.7■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 ADGRG5Q8IZF4 528 aa24.7■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 TCAIMQ8N3R3 496 aa24.7■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa24.7■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZBTB18Q99592 522 aa24.7■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC29A3Q9BZD2 475 aa24.7■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa24.7■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 SUFUQ9UMX1 484 aa24.7■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 TPST1O60507 370 aa24.69■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 SYN1P17600 705 aa24.69■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 DCDC1P59894 354 aa24.69■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 PRKCQQ04759 706 aa24.69■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 CAMK1Q14012 370 aa24.69■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 KIAA0040Q15053 153 aa24.69■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa24.69■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa24.69■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 LIX1Q8N485 282 aa24.69■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF366Q8N895 744 aa24.69■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 ELMO1Q92556 727 aa24.69■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 FAM192AQ9GZU8 254 aa24.69■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 PER2O15055 1255 aa24.68■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 KRT6AP02538 564 aa24.68■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 KRT6BP04259 564 aa24.68■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 XPAP23025 273 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 KRT6CP48668 564 aa24.68■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 DHCR24Q15392 516 aa24.68■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 CACHD1Q5VU97 1274 aa24.68■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 TTC23LQ6PF05 361 aa24.68■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 PYCR2Q96C36 320 aa24.68■■□□□ 1.54
PLEKHF1-201ENST00000436066 CGREF1Q99674 301 aa24.68■■□□□ 1.54
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