RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424636.2

TRDMT1-204, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRDMT1, Length 333 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-204ENST00000424636 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 MAGEB17A8MXT2 336 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 ZWINTO95229 277 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 HMBSP08397 361 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 ACP2P11117 423 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 SELLP14151 372 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 ALOX12P18054 663 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 ITGA3P26006 1051 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 SUOXP51687 545 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 THOP1P52888 689 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 IRF3Q14653 427 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 MELKQ14680 651 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 WTAPQ15007 396 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 IGSF11Q5DX21 431 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 MFSD6Q6ZSS7 791 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 HAUS6Q7Z4H7 955 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 CALML4Q96GE6 196 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 C18orf12Q96KH6 178 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 MYADMQ96S97 322 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 RTP3Q9BQQ7 232 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 TRIM51Q9BSJ1 452 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 KIFC3Q9BVG8 833 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 PSD3Q9NYI0 1048 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 STK26Q9P289 416 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 VPS28Q9UK41 221 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 LNP1A1A4G5 178 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 A8MU10 97 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 SLC22A2O15244 555 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 TSPAN1O60635 241 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 PRAMEF11O60813 436 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 AVILO75366 819 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 EDN1P05305 212 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 PRLRP16471 622 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 TYMPP19971 482 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 NRIP1P48552 1158 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 SIRPAP78324 504 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 UGP2Q16851 508 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 DUSP28Q4G0W2 176 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 FFAR4Q5NUL3 377 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 SZRD1Q7Z422 152 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 FAM114A1Q8IWE2 563 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 CFAP206Q8IYR0 622 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 FBXL16Q8N461 479 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 FBXO39Q8N4B4 442 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 POC5Q8NA72 575 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 APPL2Q8NEU8 664 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 OR1J1Q8NGS3 322 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 SLC47A1Q96FL8 570 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 SGK494Q96LW2 274 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 OR6C1Q96RD1 312 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 PAFAH2Q99487 392 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 ABHD6Q9BV23 337 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 TEX12Q9BXU0 123 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 SPATC1LQ9H0A9 340 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 GHITMQ9H3K2 345 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 KCNK15Q9H427 330 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 PELI2Q9HAT8 420 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 SIX2Q9NPC8 291 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 TBC1D22BQ9NU19 505 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 PLAGL1Q9UM63 463 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 ZNF148Q9UQR1 794 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 TMEM5Q9Y2B1 443 aa2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 LOC100509620A0A075B734 347 aa2.88□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa2.88□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 PRR32B1ATL7 298 aa2.88□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 DNM1LO00429 736 aa2.88□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 TO15178 435 aa2.88□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 TRMUO75648 421 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 NADKO95544 446 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 EML2O95834 649 aa2.88□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 CLPTM1O96005 669 aa2.88□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 CSH1P0DML2 217 aa2.88□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 CSH2P0DML3 217 aa2.88□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 BMXP51813 675 aa2.88□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 STAT2P52630 851 aa2.88□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 PDX1P52945 283 aa2.88□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 PNLIPRP2P54317 469 aa2.88□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 LGALS3BPQ08380 585 aa2.88□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 RIGQ13278 110 aa2.88□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 CUL4AQ13619 759 aa2.88□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 MDH1BQ5I0G3 518 aa2.88□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 LCE1CQ5T751 118 aa2.88□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.88□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 FAM205BPQ63HN1 556 aa2.88□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 ZNF774Q6NX45 483 aa2.88□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 AACSQ86V21 672 aa2.88□□□□□ -1.95
TRDMT1-204ENST00000424636 COMMD2Q86X83 199 aa2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.6 ms