RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 BAP1Q92560 729 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF516Q92618 1163 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 UBE2E3Q969T4 207 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 VPS35Q96QK1 796 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM209Q96SK2 561 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC38A3Q99624 504 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 BCL2L14Q9BZR8 327 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 NMRAL1Q9HBL8 299 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 BIN3Q9NQY0 253 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 ETNK2Q9NVF9 386 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM86C1Q9NVL1 165 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 KCNK4Q9NYG8 393 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 HMGXB4Q9UGU5 601 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 PADI2Q9Y2J8 665 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 WDR27A2RRH5 827 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM114B3SHH9 223 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 H3BN98 237 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 MRASO14807 208 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 INSIG1O15503 277 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 IFNA10P01566 189 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 ANXA5P08758 320 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 DLDP09622 509 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 GRIA2P42262 883 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 GSTM5P46439 218 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 RFX3P48380 749 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 KCNQ1P51787 676 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 OR2B6P58173 313 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 FOLH1Q04609 750 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 DPYSQ14117 519 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 E2F2Q14209 437 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 RNF43Q68DV7 783 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC39A4Q6P5W5 647 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 BORAQ6PGQ7 559 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM151BQ6UXP7 276 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 KIF18BQ86Y91 864 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC22A9Q8IVM8 553 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 ALLCQ8N6M5 410 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF540Q8NDQ6 660 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 ITFG1Q8TB96 612 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 ASB15Q8WXK1 588 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 NXNL1Q96CM4 212 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 P2RY11Q96G91 374 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 CDRT15Q96T59 188 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 TCF12Q99081 682 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 SEPHS2Q99611 448 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 CRISPLD1Q9H336 500 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 RIBC2Q9H4K1 309 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 TM9SF3Q9HD45 589 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 SPHK2Q9NRA0 654 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM184CQ9NVA4 438 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 GNG8Q9UK08 70 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 GMPPBQ9Y5P6 360 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 AP4B1Q9Y6B7 739 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 GON4LQ3T8J9 2241 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 LINC01553A4QN01 128 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 OR2AT4A6NND4 320 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 J3QR89 54 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 M0R036 132 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 SNX3O60493 162 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 KAT7O95251 611 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 SERPINE1P05121 402 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 GSTT2P0CG29 244 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 ETS2P15036 469 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 HTR2AP28223 471 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 CRABP2P29373 138 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 NOS3P29474 1203 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC6A4P31645 630 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 SPAM1P38567 509 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 ELK3P41970 407 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 GLRBP48167 497 aa4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
ANKRD28-202ENST00000412318 PTPRNQ16849 979 aa4.34□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms