RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 RMDN2Q96LZ7 410 aa20.28■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 CMKLR1Q99788 373 aa20.28■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 CCDC77Q9BR77 488 aa20.28■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa20.28■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 IKBKGQ9Y6K9 419 aa20.28■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 PLD2O14939 933 aa20.27■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 HGSO14964 777 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 UBXN7O94888 489 aa20.27■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 CAPNS1P04632 268 aa20.27■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 ITGB6P18564 788 aa20.27■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 CHRM3P20309 590 aa20.27■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 NDUFS1P28331 727 aa20.27■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 ABCG1P45844 678 aa20.27■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 LIMK2P53671 638 aa20.27■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 PLCL1Q15111 1095 aa20.27■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 TMED2Q15363 201 aa20.27■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 TMEM71Q6P5X7 295 aa20.27■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF549Q6P9A3 640 aa20.27■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 IGF2-ASQ6U949 168 aa20.27■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 KRT222Q8N1A0 295 aa20.27■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 MREGQ8N565 214 aa20.27■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 KCNJ9Q92806 393 aa20.27■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 CCDC74BQ96LY2 380 aa20.27■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 RBBP8Q99708 897 aa20.27■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 SEMA6CQ9H3T2 930 aa20.27■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 LOXL2Q9Y4K0 774 aa20.27■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa20.27■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 KIF26BQ2KJY2 2108 aa20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 IQCF5A8MTL0 148 aa20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 KPNA5O15131 536 aa20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 NIPSNAP2O75323 286 aa20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 INHBAP08476 426 aa20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 JMJD7P0C870 316 aa20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 THRAP10827 490 aa20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 AMD1P17707 334 aa20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 SPRP35270 261 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 MSH2P43246 934 aa20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 CAPZBP47756 277 aa20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 KRT33BQ14525 404 aa20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 FAM45BPQ6NSW5 357 aa20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 KLHL35Q6PF15 583 aa20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 FOXR1Q6PIV2 292 aa20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 XKR5Q6UX68 686 aa20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 PDZD3Q86UT5 571 aa20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 PLXDC1Q8IUK5 500 aa20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 FBXO39Q8N4B4 442 aa20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 FAM45AQ8TCE6 357 aa20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 ZFPM2Q8WW38 1151 aa20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 NCSTNQ92542 709 aa20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 VPS39Q96JC1 886 aa20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 PAFAH2Q99487 392 aa20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 NDNQ99608 321 aa20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 OR52A5Q9H2C5 316 aa20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 THSD1Q9NS62 852 aa20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa20.25■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa20.25■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 VPS26AO75436 327 aa20.25■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 PREPP48147 710 aa20.25■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 TBC1D25Q3MII6 688 aa20.25■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 HECTD2Q5U5R9 776 aa20.25■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 TAOK1Q7L7X3 1001 aa20.25■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 OTOAQ7RTW8 1153 aa20.25■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 SLC44A1Q8WWI5 657 aa20.25■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 ELMO2Q96JJ3 720 aa20.25■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 MCMBPQ9BTE3 642 aa20.25■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 TAS2R13Q9NYV9 303 aa20.25■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 FAM155BO75949 473 aa20.24■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 APOA4P06727 396 aa20.24■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 ITGA2BP08514 1039 aa20.24■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 CCR7P32248 378 aa20.24■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 ERVPABLB-1P60509 514 aa20.24■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 CFHR1Q03591 330 aa20.24■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 UGT3A1Q6NUS8 523 aa20.24■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 AGBL5Q8NDL9 886 aa20.24■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 FAM136AQ96C01 138 aa20.24■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa20.24■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 PPCSQ9HAB8 311 aa20.24■□□□□ 0.83
C4orf48-201ENST00000409248 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms