RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 BCORP1Q8N888 145 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 PROKR1Q8TCW9 393 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 TRABDQ9H4I3 376 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 XKR8Q9H6D3 395 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 EPS8L2Q9H6S3 715 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 SLC22A11Q9NSA0 550 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 ACTR10Q9NZ32 417 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP18.61■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 PKDREJQ9NTG1 2253 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 C2orf74A8MZ97 194 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 SOCS6O14544 535 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 PCDH17O14917 1159 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 CHRNA4P43681 627 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 MYL5Q02045 173 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 VWA2Q5GFL6 755 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 LINC00696Q6ZRV3 163 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 TRIM73Q86UV7 250 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 SLC25A41Q8N5S1 370 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 PHC3Q8NDX5 983 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 OR52E1Q8NGJ3 308 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 TXLNGQ9NUQ3 528 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 SMOXQ9NWM0 555 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC168Q8NDH2 2452 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 CYP1A2P05177 515 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 MMP11P24347 488 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 BCL7AQ4VC05 210 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 SIRPB2Q5JXA9 342 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 NPNTQ6UXI9 565 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 SPNS3Q6ZMD2 512 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 AMIGO1Q86WK6 493 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF398Q8TD17 642 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 RAPGEF5Q92565 580 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 TAAR6Q96RI8 345 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 CCM2Q9BSQ5 444 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 LHPPQ9H008 270 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 CDC23Q9UJX2 597 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD12-201ENST00000404162 CCL21O00585 134 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 KLHL18O94889 574 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 KDELR1P24390 212 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 TMPRSS15P98073 1019 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 TEX44Q53QW1 395 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 SPESP1Q6UW49 350 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 KDELC1Q6UW63 502 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 GFRALQ6UXV0 394 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 OR1N1Q8NGS0 311 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 KLHL33A6NCF5 533 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 WNT3AP56704 352 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 Q0VFX4 171 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 PRKG2Q13237 762 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 KIRREL2Q6UWL6 708 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 HM13Q8TCT9 377 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 NR4A3Q92570 626 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 NACC2Q96BF6 587 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 PYGMP11217 842 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 ITGAXP20702 1163 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 CD68P34810 354 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 MFAP5Q13361 173 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 PDK1Q15118 436 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 SARM1Q6SZW1 724 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 ISLR2Q6UXK2 745 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 HOOK3Q86VS8 718 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 TEKT5Q96M29 485 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 OLFM3Q96PB7 478 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 OR2A14Q96R47 310 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 HGH1Q9BTY7 390 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 OR52A5Q9H2C5 316 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 HACD3Q9P035 362 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 FAM153AQ9UHL3 310 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 PKP3Q9Y446 797 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 C19orf84I3L1E1 186 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 PROSCO94903 275 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 PRAMEF1O95521 474 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 UGT2B7P16662 529 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 ALAS2P22557 587 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXD12-201ENST00000404162 PTPN3P26045 913 aa18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms