RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 USP43Q70EL4 1123 aa16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF438Q7Z4V0 828 aa16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 VN1R5Q7Z5H4 357 aa16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 GOLM1Q8NBJ4 401 aa16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 CXorf40AQ8TE69 158 aa16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 MTRRQ9UBK8 725 aa16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 GRM6O15303 877 aa16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 CLIC3O95833 236 aa16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 TIE1P35590 1138 aa16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 RPS24P62847 133 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 CREMQ03060 361 aa16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 EMX2Q04743 252 aa16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 MED27Q6P2C8 311 aa16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 HACD2Q6Y1H2 254 aa16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 GPR65Q8IYL9 337 aa16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 LRRC17Q8N6Y2 441 aa16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF347Q96SE7 839 aa16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 CORO1BQ9BR76 489 aa16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 ITM2BQ9Y287 266 aa16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 MYH4Q9Y623 1939 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 NFKB2Q00653 900 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 MYBPC3Q14896 1274 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 OR2T5Q6IEZ7 315 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 NAPRTQ6XQN6 538 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 C17orf64Q86WR6 236 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 OR2T29Q8NH02 315 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 CFAP97Q9P2B7 532 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 H0YAE9 185 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 ACAT2Q9BWD1 397 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 KLHL33A6NCF5 533 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 FZD9O00144 591 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 CDK14O94921 469 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 CCNB2O95067 398 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 FGBP02675 491 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 G6PDP11413 515 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 ACVRL1P37023 503 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 CAPZA2P47755 286 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 DIO3P55073 304 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 DCST1Q5T197 706 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 SMYD1Q8NB12 490 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 DUSP26Q9BV47 211 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 GMEB1Q9Y692 573 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 ILVBLA1L0T0 632 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 DYRK3O43781 588 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 PRKCGP05129 697 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 GMPRP36959 345 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 SERINC3Q13530 473 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 IKBIPQ70UQ0 350 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 CDH24Q86UP0 819 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 OR4F6Q8NGB9 312 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 TMCO6Q96DC7 493 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 DIRAS2Q96HU8 199 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 ING4Q9UNL4 249 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 F2P00734 622 aa16.08■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 PGRP06401 933 aa16.08■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 CCNYL3P0C7X3 344 aa16.08■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 PRG2P13727 222 aa16.08■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 MYL9P24844 172 aa16.08■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 FLT3LGP49771 235 aa16.08■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 IL18R1Q13478 541 aa16.08■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 ATP6AP1Q15904 470 aa16.08■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 BICRALQ6AI39 1079 aa16.08■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 CYP2U1Q7Z449 544 aa16.08■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 CEP97Q8IW35 865 aa16.08■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM199Q8N511 208 aa16.08■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 MAPK15Q8TD08 544 aa16.08■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 PEX13Q92968 403 aa16.08■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 COL26A1Q96A83 441 aa16.08■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 MOCOSQ96EN8 888 aa16.08■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 OSBPL10Q9BXB5 764 aa16.08■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 SCML2Q9UQR0 700 aa16.08■□□□□ 0.17
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC38A8A6NNN8 435 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 ENPP3O14638 875 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 PSMA3P25788 255 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 PTPN5P54829 565 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 RHEBL1Q8TAI7 183 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 RRAGCQ9HB90 399 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 SEMA3GQ9NS98 782 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2-201ENST00000398073 G3V2L1 256 aa16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms