RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINGO4Q6UY18 593 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANO5Q75V66 913 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 DET1Q7L5Y6 550 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC26A9Q7LBE3 791 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHST3Q7LGC8 479 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMIM29Q86T20 159 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 COMMD2Q86X83 199 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLD3Q8IV08 490 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR2T12Q8NG77 320 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR5M8Q8NGP6 311 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNF128Q8TEB7 428 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC107Q8WV48 283 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 TM9SF4Q92544 642 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARSGQ96EG1 525 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ALG14Q96F25 216 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 SGK494Q96LW2 274 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 NODALQ96S42 347 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYADMQ96S97 322 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 PSD2Q9BQI7 771 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 BTBD10Q9BSF8 475 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPR88Q9GZN0 384 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 VN1R1Q9GZP7 353 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 MMP28Q9H239 520 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 C5AR2Q9P296 337 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 WDR35Q9P2L0 1181 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 TUBE1Q9UJT0 475 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC7A7Q9UM01 511 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 PADI2Q9Y2J8 665 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRP12Q9Y561 859 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A1W2PPM1 405 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM221A6NGB7 291 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSPY2A6NKD2 308 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR6C76A6NM76 312 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 IFITM10A6NMD0 228 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIM77I1YAP6 450 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 CAVIN2O95810 425 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGLV2-11P01706 119 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 FYNP06241 537 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRSS1P07477 247 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAB40ALP0C0E4 278 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC175P0C221 793 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSPY3P0CV98 308 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSPY8P0CW00 308 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 PAX1P15863 534 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERCC2P18074 760 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 NR1D1P20393 614 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSPY1Q01534 308 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 DMPKQ09013 629 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 COG2Q14746 738 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 TNIP1Q15025 636 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 VWC2Q2TAL6 325 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLHL22Q53GT1 634 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLHL26Q53HC5 615 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLA2G4FQ68DD2 849 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 CORO6Q6QEF8 472 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC186Q7Z3E2 898 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLFN11Q7Z7L1 901 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 ISCA2Q86U28 154 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 MFN1Q8IWA4 741 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARHGAP24Q8N264 748 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIML1Q8N9V2 468 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC4A11Q8NBS3 891 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRC8CQ8TDW0 803 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 SSMEM1Q8WWF3 244 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC47A1Q96FL8 570 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 NSL1Q96IY1 281 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 RHNO1Q9BSD3 238 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 NUP85Q9BW27 656 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKRD2Q9GZV1 360 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 GKN1Q9NS71 199 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 ECHDC1Q9NTX5 307 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 COQ3Q9NZJ6 369 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANAPC5Q9UJX4 755 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACAD8Q9UKU7 415 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCL27Q9Y4X3 112 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 E9PI62 339 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM72CH0Y354 149 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 H7C0S8 307 aa2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms